218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0681 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  956    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  63.35 
 
 
474 aa  630  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  62.71 
 
 
474 aa  626  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  61.44 
 
 
443 aa  549  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  50.31 
 
 
484 aa  479  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  48.21 
 
 
477 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  49.46 
 
 
480 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  49.46 
 
 
480 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  49.67 
 
 
480 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  48.6 
 
 
500 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  49.46 
 
 
480 aa  464  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  47.28 
 
 
482 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  48.43 
 
 
484 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  45.68 
 
 
493 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  50.9 
 
 
477 aa  457  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  48.12 
 
 
498 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  46.9 
 
 
486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  49.27 
 
 
486 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  47.95 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  47.81 
 
 
484 aa  451  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  46.01 
 
 
482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  50.44 
 
 
477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  48.64 
 
 
484 aa  444  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  48.41 
 
 
473 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  46.19 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  47.65 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  51.02 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  46.01 
 
 
477 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  48.32 
 
 
486 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  45.99 
 
 
486 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  44.73 
 
 
476 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  45.65 
 
 
476 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  46.98 
 
 
486 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  45.44 
 
 
476 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  45.22 
 
 
476 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  45.8 
 
 
480 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  45.77 
 
 
460 aa  429  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  49.21 
 
 
477 aa  431  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  46.76 
 
 
486 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  46.09 
 
 
485 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  46.71 
 
 
476 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  45.52 
 
 
485 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  46.86 
 
 
485 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  46.17 
 
 
484 aa  426  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  44.68 
 
 
482 aa  424  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  44.54 
 
 
486 aa  424  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  46.69 
 
 
486 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  48.5 
 
 
432 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  44.59 
 
 
476 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  45.28 
 
 
479 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  45.47 
 
 
481 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  43.16 
 
 
475 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  43.92 
 
 
476 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  43.1 
 
 
477 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  46.39 
 
 
486 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  43.52 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  43.75 
 
 
488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  45.49 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  43.61 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  43.19 
 
 
488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  43.61 
 
 
487 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  45.13 
 
 
475 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  43.07 
 
 
488 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  46.7 
 
 
473 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  45.61 
 
 
472 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  45.06 
 
 
472 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.17 
 
 
514 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  45.38 
 
 
475 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  45.2 
 
 
473 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  41.46 
 
 
502 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  44.71 
 
 
465 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  48.07 
 
 
988 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  43.71 
 
 
963 aa  379  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  41.68 
 
 
478 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  41.81 
 
 
447 aa  349  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  43.13 
 
 
462 aa  349  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  35.59 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  31.12 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  29.25 
 
 
472 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  31.1 
 
 
402 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  30.9 
 
 
514 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.23 
 
 
396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  31.24 
 
 
398 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  28.48 
 
 
466 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  26.76 
 
 
463 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  28.11 
 
 
466 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  31.35 
 
 
470 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  29.89 
 
 
372 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  27.88 
 
 
382 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  28.13 
 
 
511 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  28.96 
 
 
411 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.24 
 
 
398 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  27.95 
 
 
399 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  30.05 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  28.96 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  29.84 
 
 
409 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  28 
 
 
406 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  29.01 
 
 
393 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.4 
 
 
395 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  31.21 
 
 
478 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>