217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1453 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  998    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  54.23 
 
 
484 aa  548  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  52.73 
 
 
500 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  54.81 
 
 
484 aa  546  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  53.4 
 
 
498 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  51.46 
 
 
480 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  51.67 
 
 
480 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  54.09 
 
 
482 aa  534  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  52.31 
 
 
480 aa  533  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  51.88 
 
 
480 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  54.6 
 
 
484 aa  530  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  52.42 
 
 
486 aa  525  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  53.43 
 
 
482 aa  525  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  53.2 
 
 
484 aa  522  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  52.84 
 
 
473 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  53.36 
 
 
460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  51.77 
 
 
486 aa  511  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  51.66 
 
 
488 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  49.9 
 
 
486 aa  510  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  51.04 
 
 
486 aa  508  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  51.57 
 
 
484 aa  508  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  51.67 
 
 
488 aa  504  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  50.42 
 
 
477 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  49.27 
 
 
486 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.58 
 
 
481 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  48.11 
 
 
478 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  48.01 
 
 
486 aa  475  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  48.84 
 
 
477 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  48.39 
 
 
502 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  49.26 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  49.13 
 
 
963 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  47.58 
 
 
477 aa  463  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  46.92 
 
 
477 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  46.84 
 
 
474 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  46.67 
 
 
493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  45.84 
 
 
474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  49.34 
 
 
480 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  46.01 
 
 
472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  45.53 
 
 
485 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  44.91 
 
 
485 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.59 
 
 
514 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  44.91 
 
 
485 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  45.02 
 
 
486 aa  435  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  46.22 
 
 
477 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  44.81 
 
 
486 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  45.53 
 
 
477 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  45.21 
 
 
485 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  43.82 
 
 
477 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  51.82 
 
 
988 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  46.41 
 
 
475 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  45.38 
 
 
476 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  47.51 
 
 
486 aa  423  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  48.52 
 
 
432 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  45.13 
 
 
476 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  46.67 
 
 
488 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  45.49 
 
 
476 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  45.99 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  46.67 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  44.44 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  46.88 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  47.47 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  44.03 
 
 
476 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  47.58 
 
 
472 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  46.33 
 
 
443 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  45.87 
 
 
476 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  46.35 
 
 
479 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  45.22 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  43.91 
 
 
465 aa  398  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  44.33 
 
 
475 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  45 
 
 
484 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  42.74 
 
 
473 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  44.26 
 
 
475 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  42.95 
 
 
473 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  42 
 
 
478 aa  372  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  40.56 
 
 
447 aa  333  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  40.85 
 
 
462 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  34.07 
 
 
451 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.57 
 
 
396 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  30.81 
 
 
514 aa  183  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  29.78 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  29.71 
 
 
511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  30.04 
 
 
402 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  29.17 
 
 
393 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.44 
 
 
395 aa  156  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  30.93 
 
 
395 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  31.55 
 
 
395 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  28.02 
 
 
395 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  29.66 
 
 
407 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  29.66 
 
 
407 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  29.68 
 
 
466 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  29.65 
 
 
384 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  29.4 
 
 
390 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  27.73 
 
 
399 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  30.16 
 
 
407 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  28.77 
 
 
389 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  28.42 
 
 
410 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  30.35 
 
 
405 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  29.44 
 
 
470 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  29.51 
 
 
405 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  30.12 
 
 
405 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>