205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1011 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1011  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1037    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1051  hypothetical protein  69.88 
 
 		 511 aa  739    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.738167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  32.49 
 
 		 440 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  29.31 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  30.34 
 
 		 439 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  28.49 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  29.21 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  29.09 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  30.81 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 474 aa  140  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  29.17 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  29.02 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  29.68 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  29.69 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  32.35 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  25.38 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  26.11 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  24.44 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  29.57 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  25.8 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  28.25 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  25.12 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  26.47 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  27.42 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  25.31 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  26.05 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0873  hypothetical protein  24.52 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250063  hitchhiker  0.0000000169408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  24.77 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  26.89 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  28.3 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  24.79 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  26.93 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  26.77 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  26 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  26.76 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  28.57 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  25.52 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  26.05 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  29.94 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  24.94 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  23.83 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  27.85 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  25.46 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  25.69 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  24.48 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  24.43 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  28.48 
 
 		 988 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  22.51 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  26.75 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  26.07 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  25.28 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  24.38 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  24.25 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  26.75 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  24.27 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  25.08 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  24.36 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  23.66 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  27.34 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  27.74 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  26.37 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  24.52 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  27.53 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  27.29 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  25.17 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  27.56 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4254  protein of unknown function UPF0027  24.18 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  23.59 
 
 		 371 aa  67  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  25.88 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  25.88 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  25.55 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  24.94 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  27.51 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  25.25 
 
 		 405 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  24.7 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  25.06 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  24.24 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  28.76 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  24.61 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  28.27 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  28.25 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  26.37 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  23.35 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  25.05 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  27.55 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  26.12 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3106  protein of unknown function UPF0027  30.36 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  24.55 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  25.83 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  24.78 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  26.17 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  21.79 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  21.77 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  26 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  27.15 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  21.79 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  24.51 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  31.16 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  21.79 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>