218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5648 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  952    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  70.13 
 
 		 463 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  58.26 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  57.63 
 
 		 466 aa  535  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  32.93 
 
 		 514 aa  213  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  32.91 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  29.25 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  30.7 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  31.9 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  29.93 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  34.3 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  30.07 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  31.98 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  30.49 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  31.95 
 
 		 484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  29.76 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  33.41 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  34.39 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  31.36 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  31.26 
 
 		 498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  32.49 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  32.4 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  30.3 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  29.93 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  30.39 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  32.33 
 
 		 460 aa  149  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  32.04 
 
 		 514 aa  149  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  29.98 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  34.05 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  28.51 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  29.72 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  31.59 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  32.75 
 
 		 477 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  33.78 
 
 		 480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  29.98 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  31.69 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  31.45 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  32.19 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  30.52 
 
 		 477 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  30.63 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  31.15 
 
 		 486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  31.21 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  30.24 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  32.81 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  29.14 
 
 		 475 aa  140  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  29.29 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  30.66 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  29.72 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  33.78 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  29.06 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  29.83 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  29.81 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  27.89 
 
 		 963 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  32.17 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  32.65 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  29.86 
 
 		 486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  30.97 
 
 		 486 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  30.07 
 
 		 478 aa  133  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  31.09 
 
 		 475 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  33.11 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  31 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  32.95 
 
 		 406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  35.02 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  31.59 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  30.37 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  31.12 
 
 		 476 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  30.7 
 
 		 482 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  32.19 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  27.52 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  38.55 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  29.75 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  31.39 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  29.62 
 
 		 486 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  31.55 
 
 		 988 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  29.83 
 
 		 486 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  33.62 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  31.54 
 
 		 406 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  31.03 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  31.84 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  29.08 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  37.22 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  28.8 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.45 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.8 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  30.35 
 
 		 395 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  30.42 
 
 		 430 aa  124  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  31.4 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.72 
 
 		 398 aa  123  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  30.11 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  35.09 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  28.67 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  27.31 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  24.88 
 
 		 357 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  31.63 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  28.76 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  28.93 
 
 		 493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  30.47 
 
 		 485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>