216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2359 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  68.28 
 
 		 476 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  65.76 
 
 		 476 aa  662    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  66.39 
 
 		 476 aa  665    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  961    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  71.91 
 
 		 477 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  70.59 
 
 		 476 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  69.96 
 
 		 476 aa  663    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  67.44 
 
 		 476 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  66.6 
 
 		 475 aa  614  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  58.49 
 
 		 477 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  60.46 
 
 		 475 aa  585  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  56.09 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  59.87 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  52.11 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  48.85 
 
 		 500 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  52.36 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  49.69 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  48.96 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  49.48 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  50 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  49.67 
 
 		 486 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  50.65 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  47.68 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  47.89 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  47.93 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  47.93 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  48.53 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  49.78 
 
 		 486 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  49.57 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  49.03 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  49.9 
 
 		 482 aa  444  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  48.25 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  46.71 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  50.1 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  49.46 
 
 		 498 aa  440  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  47.49 
 
 		 480 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  50 
 
 		 480 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  46.41 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.26 
 
 		 481 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  47.41 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  47.08 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  47.59 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  47.52 
 
 		 485 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  47.94 
 
 		 460 aa  428  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  47.39 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  47.73 
 
 		 485 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  46.04 
 
 		 482 aa  423  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  46.35 
 
 		 486 aa  425  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  45.23 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  46.88 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  49.79 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  46.09 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  46.35 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  47.59 
 
 		 488 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  49.89 
 
 		 477 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  46.7 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  45.51 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  51.59 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  52.75 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  52.3 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  44.09 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.07 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  51.59 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  46.87 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  48.73 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  48.09 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  48.94 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  53.26 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  48.52 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  43.31 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  49.87 
 
 		 988 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  45.32 
 
 		 473 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  43.4 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  41.41 
 
 		 963 aa  348  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  38.67 
 
 		 462 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  38.28 
 
 		 447 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  30.35 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  33.41 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  31.96 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  32.96 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  31.67 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  32.9 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  31.77 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  32.2 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  31.13 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  28.41 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  34.35 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  32.68 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  33.11 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  31.46 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  30.45 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  30.8 
 
 		 406 aa  143  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  31.45 
 
 		 466 aa  143  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  31.03 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4254  protein of unknown function UPF0027  30.47 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  31.3 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  31.42 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  30.37 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.63 
 
 		 398 aa  140  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.72 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>