218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12650 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  870    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  71.23 
 
 
465 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  70.9 
 
 
475 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  67.05 
 
 
472 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  66.59 
 
 
472 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  53.42 
 
 
500 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  57.6 
 
 
476 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  51.37 
 
 
480 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  52.98 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  53.64 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  51.37 
 
 
480 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  50.91 
 
 
480 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  53.23 
 
 
476 aa  438  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  48.52 
 
 
482 aa  436  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  53.23 
 
 
476 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  53.24 
 
 
475 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  54.94 
 
 
486 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  51.7 
 
 
477 aa  435  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  49.77 
 
 
480 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  48.5 
 
 
472 aa  435  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  55.4 
 
 
477 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  49.43 
 
 
474 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  49.89 
 
 
474 aa  428  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  53.21 
 
 
477 aa  430  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  52.29 
 
 
477 aa  425  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  51.14 
 
 
486 aa  428  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  49.77 
 
 
460 aa  427  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  57.34 
 
 
476 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  50.11 
 
 
486 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  55.07 
 
 
476 aa  421  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  51.94 
 
 
486 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  50.34 
 
 
486 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  53.92 
 
 
476 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  49.32 
 
 
482 aa  420  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  52.3 
 
 
477 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  51.6 
 
 
477 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  53.74 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  55.2 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  52.98 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  53 
 
 
473 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  49.66 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  50 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  50.11 
 
 
482 aa  412  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  48.64 
 
 
498 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  48.19 
 
 
486 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  48.42 
 
 
486 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  50.46 
 
 
481 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  48.75 
 
 
485 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  48.86 
 
 
484 aa  410  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  50.8 
 
 
486 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  54.84 
 
 
476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  46.17 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  50.46 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  48.07 
 
 
485 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  52.3 
 
 
476 aa  398  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  48.07 
 
 
485 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  49.32 
 
 
484 aa  398  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  46.49 
 
 
485 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  53.27 
 
 
487 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  49.2 
 
 
486 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  49.21 
 
 
514 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  53.05 
 
 
487 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  52.37 
 
 
488 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  52.17 
 
 
988 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  52.18 
 
 
484 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  51.92 
 
 
479 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  45.6 
 
 
963 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  47.62 
 
 
484 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  46.94 
 
 
488 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  46.01 
 
 
488 aa  359  5e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  46.45 
 
 
473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  44.39 
 
 
473 aa  348  9e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  45.96 
 
 
478 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  43.74 
 
 
502 aa  338  8e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  41.44 
 
 
462 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  40.83 
 
 
447 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  33.18 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  34.47 
 
 
463 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  33.94 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  30.56 
 
 
409 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  30.72 
 
 
393 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  33.41 
 
 
402 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  32.83 
 
 
514 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  32.39 
 
 
470 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  32.4 
 
 
466 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  28.9 
 
 
396 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.9 
 
 
466 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  31.66 
 
 
410 aa  150  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.64 
 
 
398 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  29.35 
 
 
411 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  33.03 
 
 
398 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  29.35 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  34.23 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  33.03 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  29.72 
 
 
393 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  31.31 
 
 
406 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  32.43 
 
 
409 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.87 
 
 
384 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  29.81 
 
 
388 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  33.26 
 
 
409 aa  143  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>