221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0759 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  100 
 
 		 357 aa  727    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  38.57 
 
 		 379 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  37.47 
 
 		 410 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  37.57 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  38.52 
 
 		 379 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  38.52 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  37.85 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  38.52 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  37.91 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  37.64 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  37.43 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  37.74 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  37.4 
 
 		 392 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  37.98 
 
 		 379 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  37.95 
 
 		 388 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  37.95 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  36.74 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  35.48 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  33.33 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  34.51 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  36.46 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  34.49 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  41.14 
 
 		 188 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  28.61 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  29.34 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  27.57 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  26.77 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  28.12 
 
 		 447 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  24.88 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  26.45 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  25.11 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  29.37 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  26.27 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  27.34 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  28.61 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  26.07 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  28.42 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  27.17 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  26.05 
 
 		 466 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  28.98 
 
 		 508 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  26.23 
 
 		 470 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  24.67 
 
 		 473 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  25.46 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  26.82 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  28.9 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  24.67 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  26.98 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  25.8 
 
 		 407 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  25.2 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  26.64 
 
 		 472 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  27.05 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  25.88 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  25.85 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  27.27 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  28.68 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  27.49 
 
 		 399 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  29.33 
 
 		 478 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  26.16 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  25.94 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  24.73 
 
 		 385 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  28.34 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  24.06 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  26.74 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  28.5 
 
 		 473 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  27.42 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  26.54 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  27.65 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  26.78 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  25.12 
 
 		 410 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  25.23 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  25.25 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  24.46 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  26.23 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  27.87 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  25.69 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  24.69 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  30.95 
 
 		 480 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  25 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  25 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  26.91 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  24.69 
 
 		 406 aa  99.4  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  24.57 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  25 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  25.68 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  27.07 
 
 		 480 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  24.26 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  25 
 
 		 401 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  25.68 
 
 		 405 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  24.75 
 
 		 408 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  25.06 
 
 		 397 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  24.69 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  23.85 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  24.15 
 
 		 411 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  25.25 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  25.6 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  26.51 
 
 		 715 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>