221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0344 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  98.68 
 
 		 379 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  98.94 
 
 		 379 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  99.21 
 
 		 379 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  98.68 
 
 		 379 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  75.33 
 
 		 379 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  74.27 
 
 		 388 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  74.27 
 
 		 388 aa  589  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  64.55 
 
 		 379 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  64.29 
 
 		 379 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  61.44 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  59.84 
 
 		 373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  59.57 
 
 		 373 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  57.14 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  52.04 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  55.32 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  44.7 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  75.86 
 
 		 188 aa  279  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  37.98 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  43.96 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  42.04 
 
 		 396 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  41.64 
 
 		 395 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  37.89 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  31.8 
 
 		 407 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  28.87 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  28.64 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.81 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  29.86 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  30.84 
 
 		 473 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  30.49 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  31.13 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  28.15 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  30.22 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.81 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.32 
 
 		 404 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.88 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  30.19 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.04 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  30.58 
 
 		 405 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  31.2 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  27.51 
 
 		 443 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  30.96 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  29.93 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  28.41 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  31.42 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  28.83 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  31.47 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  31.37 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  30.66 
 
 		 407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  30.66 
 
 		 407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  29.51 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  29.51 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  30.52 
 
 		 478 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  30.62 
 
 		 428 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  30.43 
 
 		 466 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  31.23 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  30.41 
 
 		 393 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  30.56 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  29.34 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  29.95 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  30.07 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.58 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  30.66 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  27.79 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  30.07 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  29.35 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.71 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  29.58 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  30.8 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.83 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  29.64 
 
 		 477 aa  129  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  30.29 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  28.11 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.45 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  29.58 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  30.98 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  29.47 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  29.2 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  30.32 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  29.75 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  30.99 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  28.68 
 
 		 395 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  28.05 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  35.82 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  29.21 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  31.33 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.87 
 
 		 409 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  28.81 
 
 		 484 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  30.71 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  28.25 
 
 		 475 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  30.18 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  29.22 
 
 		 474 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  29.44 
 
 		 480 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  27.93 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  30.11 
 
 		 486 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  28.3 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  30.36 
 
 		 486 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  29.45 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  28.99 
 
 		 480 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  29.37 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>