220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  94.2 
 
 		 379 aa  718    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  69.66 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  65.52 
 
 		 373 aa  494  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  64.19 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  64.55 
 
 		 379 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  64.55 
 
 		 379 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  64.29 
 
 		 379 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  64.29 
 
 		 379 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  64.02 
 
 		 379 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  62.73 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  61.54 
 
 		 379 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  61.27 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  61.01 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  55.9 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  56.85 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  49.35 
 
 		 410 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  48.19 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  38.57 
 
 		 357 aa  275  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  44.74 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  44.41 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  39.64 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  63.64 
 
 		 188 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  31.64 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.1 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  33.67 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  33.56 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.38 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  30.29 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  31.04 
 
 		 465 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  29.07 
 
 		 447 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  31.53 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  27.87 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  30.88 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  30.62 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  30.6 
 
 		 404 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  30.07 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  29.88 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  30.3 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  28.71 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  29.22 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  28.31 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  29.7 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.35 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  29.32 
 
 		 480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.75 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  30.49 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  29.28 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.56 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  29.4 
 
 		 407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  29.46 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.58 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  29.71 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  28.89 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  27.01 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  26.95 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  30.23 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  31.89 
 
 		 439 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  26.95 
 
 		 411 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  27.45 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  27.45 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  29.76 
 
 		 410 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  29.12 
 
 		 407 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  29.12 
 
 		 407 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  29.58 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  28.19 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  30.53 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  26.96 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  37.22 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  29.63 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  28.99 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  29.1 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  27.21 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  28.64 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  26.96 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  27.21 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  27.33 
 
 		 480 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.17 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  29.12 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  29.45 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  27.94 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  29.57 
 
 		 488 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  33.63 
 
 		 487 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  28.19 
 
 		 408 aa  122  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  29.02 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  30.15 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  31.84 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  28.31 
 
 		 482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  33.18 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  28.86 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.17 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  26.96 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  30.18 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  30.43 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  33.41 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  30.18 
 
 		 486 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  29.62 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  29.18 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  28.63 
 
 		 474 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>