221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2040 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  78.95 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  46.65 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  44.65 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  40.85 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  43.55 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  41.4 
 
 		 373 aa  249  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  41.11 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  41.91 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  41.91 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  40.85 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  41.91 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  41.55 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  41.64 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  43.24 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  41.64 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  40.58 
 
 		 379 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  34.51 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  38.34 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  43.8 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  40.96 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  38.52 
 
 		 407 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  32.39 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  31.32 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  25.81 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  31.08 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  27.77 
 
 		 474 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  31.38 
 
 		 463 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  28.42 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  30.87 
 
 		 479 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  29.5 
 
 		 477 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  28.63 
 
 		 447 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  29.22 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  25.84 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  30.7 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  31.65 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  28.34 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  38.98 
 
 		 188 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  31.51 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  26.62 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  30.47 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  28.54 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  30.93 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  27.83 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  33.72 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  31.56 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  28.89 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.53 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  29.09 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.03 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  33.72 
 
 		 466 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  29.19 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  27.21 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  30.38 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  28.13 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  28.29 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  31.49 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  31.61 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  26.76 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  32.16 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  30.87 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  36.19 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  30.21 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  30.8 
 
 		 488 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  27.54 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  28.13 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  29.56 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  28.9 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  29.59 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  27.72 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  24.59 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  26.83 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  28.01 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  29.77 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  30.1 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  28.5 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  30.37 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  30.16 
 
 		 508 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.39 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  25.71 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  30.46 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  28.7 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  26.53 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.22 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  26.3 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  30.41 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29.95 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  27.34 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  26.35 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  31.33 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  27.93 
 
 		 393 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  26.14 
 
 		 477 aa  99.8  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  28.1 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  28.51 
 
 		 482 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  27.42 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  27.68 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  28.96 
 
 		 484 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  28.43 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>