221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0241 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  793    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  78.95 
 
 		 395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  45.01 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  44.74 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  41.53 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  40.66 
 
 		 388 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  42.04 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  40.41 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  41.78 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  41.78 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  43.13 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  41.78 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  35.48 
 
 		 357 aa  246  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  41.51 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  41.73 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  43.01 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  40.59 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  41.19 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  43.46 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  38.21 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  42.19 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  38.81 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  30.54 
 
 		 473 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  27.64 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  32.57 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  31.91 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  32.23 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  31.75 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  32.18 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  29.09 
 
 		 477 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  31.54 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.76 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  32.49 
 
 		 475 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  32.16 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  29.07 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  29.18 
 
 		 475 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  30.66 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  27.7 
 
 		 372 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  30.56 
 
 		 465 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  33.52 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  31.98 
 
 		 488 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  31.98 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  28.12 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  25.96 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  28.03 
 
 		 484 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  30.68 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  28.54 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  28.05 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  31.76 
 
 		 487 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  30.63 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  30.71 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  27.56 
 
 		 480 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  27.82 
 
 		 474 aa  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  28.34 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  32.8 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  28.25 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  30.26 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  28.67 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.22 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  28.89 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  29.45 
 
 		 500 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  29.61 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  39.55 
 
 		 188 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  30.19 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  31.66 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  30.33 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  31.86 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  28.12 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  28.8 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  36.58 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  28.29 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  28.22 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  28.42 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.17 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  29 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  28.99 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  30.13 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  27.38 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  29.51 
 
 		 476 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  30.6 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  24.72 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  29.57 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  35.66 
 
 		 472 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  27.48 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  33.08 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.94 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  29.67 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  25.24 
 
 		 451 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  28.31 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  26.46 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  30.63 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  28.27 
 
 		 482 aa  103  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  31.98 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  29.67 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  28.86 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  28.51 
 
 		 476 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  28.96 
 
 		 407 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  30.49 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  30.77 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  30.84 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>