218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4862 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  64.83 
 
 
379 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  59.47 
 
 
373 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  62.73 
 
 
379 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  58.99 
 
 
373 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  62.2 
 
 
379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  55.01 
 
 
392 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  56.88 
 
 
379 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  57.14 
 
 
379 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  57.14 
 
 
379 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  57.41 
 
 
379 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  56.88 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  53.58 
 
 
379 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  53.05 
 
 
388 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  53.05 
 
 
388 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  54.81 
 
 
384 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  46.04 
 
 
410 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  46.15 
 
 
379 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  37.43 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  43.01 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  43.28 
 
 
395 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  40.06 
 
 
407 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  53.18 
 
 
188 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  29.79 
 
 
474 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  27.88 
 
 
472 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  28.06 
 
 
443 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.95 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  29.61 
 
 
480 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  29.84 
 
 
486 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  28.7 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  27.79 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  28.73 
 
 
482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  31.08 
 
 
479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  29.25 
 
 
473 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  34.32 
 
 
463 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  34.02 
 
 
384 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  29.49 
 
 
476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  30.18 
 
 
476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  29.33 
 
 
500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  31.13 
 
 
477 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  36.39 
 
 
466 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  29.29 
 
 
473 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  29.95 
 
 
488 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  32.8 
 
 
465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  28.6 
 
 
484 aa  136  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  31.39 
 
 
486 aa  136  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  29.82 
 
 
473 aa  135  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  31.54 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  31.32 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  27.77 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  29.21 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  30.23 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  29.37 
 
 
486 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  31.37 
 
 
407 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  31.75 
 
 
486 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  30.91 
 
 
478 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  31.93 
 
 
474 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  29.23 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  30.55 
 
 
478 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  30.11 
 
 
477 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  31.09 
 
 
407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  28.7 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  32.33 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  31.68 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  29.07 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  28.89 
 
 
484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  31.38 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  31.81 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  26.2 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  31.38 
 
 
487 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  31.44 
 
 
401 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  30.18 
 
 
372 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  31.38 
 
 
488 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  29.75 
 
 
486 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  29.91 
 
 
481 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  29.95 
 
 
408 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  31.84 
 
 
472 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  31.04 
 
 
388 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  31.1 
 
 
485 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  31.2 
 
 
411 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  31.73 
 
 
389 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  30.62 
 
 
384 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  29.41 
 
 
411 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  30.16 
 
 
476 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.25 
 
 
398 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  28.57 
 
 
408 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  28.22 
 
 
514 aa  122  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  28.8 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  32.9 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  31.2 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  31.2 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  28.41 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  28.26 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  29.7 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  30.23 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  30.84 
 
 
477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  29.28 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  27.97 
 
 
477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  27.82 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  27.19 
 
 
484 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>