213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3283 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  100 
 
 		 407 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  48.67 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  37.57 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  41.73 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  41.45 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  40.06 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  38.02 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  38.81 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  36.6 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  36.6 
 
 		 388 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  39.64 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  37.11 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  37.89 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  37.63 
 
 		 379 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  36.29 
 
 		 373 aa  212  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  37.63 
 
 		 379 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  37.63 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  37.37 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  35.23 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  39.12 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  34.49 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  37.76 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  39.23 
 
 		 188 aa  113  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  26.3 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  27.67 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  29.84 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  27.7 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  29.87 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  28.61 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  29.17 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  27.02 
 
 		 466 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  32.21 
 
 		 472 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.52 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  28.19 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  28.57 
 
 		 463 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  29.49 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  29.01 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  29.03 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  25.84 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  24.67 
 
 		 488 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  28.6 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  26.65 
 
 		 473 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  24.94 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  26.91 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  28.43 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  26.8 
 
 		 470 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  27.72 
 
 		 508 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  27.94 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  23.53 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  28.26 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  27.36 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  23.15 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  23.78 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  26.83 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  26.83 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  29.1 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  26.86 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  26.56 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  27.88 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  27.93 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  26.48 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  26.32 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  26.68 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  26.32 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  28.08 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  27.59 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  26.62 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  23.95 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  27.51 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  29.47 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  29.17 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  30.69 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  27 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  23.24 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  27.18 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  26.62 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  26.62 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  28.33 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  27.35 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  27.63 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  26.93 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  27.1 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  26.93 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  26.9 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  28.38 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  29.88 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  24.44 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  27.39 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  29.23 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  27.4 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  23.97 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  22.47 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  28.95 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  31.38 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  28.86 
 
 		 484 aa  76.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  28.1 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  28.08 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  28.01 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  25.93 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  27.5 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>