219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6268 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  94.2 
 
 		 379 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  69.39 
 
 		 379 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  65.08 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  64.72 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  64.29 
 
 		 379 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  64.02 
 
 		 379 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  64.02 
 
 		 379 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  64.02 
 
 		 379 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  63.76 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  61.27 
 
 		 379 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  61.01 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  60.74 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  62.2 
 
 		 382 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  56.15 
 
 		 392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  55.84 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  48.31 
 
 		 410 aa  349  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  48.19 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  45.01 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  37.74 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  46.13 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  63.64 
 
 		 188 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  39.12 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  33.75 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  32.49 
 
 		 466 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  29.86 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  31.21 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.99 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.26 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  33.26 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  28.99 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  32.14 
 
 		 477 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  27 
 
 		 443 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.85 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  30.44 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.12 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  30.28 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  30.69 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  29.22 
 
 		 473 aa  136  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  30.9 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  30.3 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  30.37 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  30.56 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  30.6 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  28.96 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  30.32 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  29.57 
 
 		 480 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.94 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  30.37 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  30.07 
 
 		 486 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.98 
 
 		 404 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  29.9 
 
 		 430 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  29.35 
 
 		 480 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  28.32 
 
 		 482 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  28.71 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  27.59 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  30.93 
 
 		 486 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  29.7 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  30.64 
 
 		 409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  38.55 
 
 		 472 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  29.83 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  28.44 
 
 		 480 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  27.59 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  29.83 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  29.57 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  30.79 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.24 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  29.85 
 
 		 482 aa  126  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  29.46 
 
 		 405 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  29.03 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  30.13 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  30.52 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  29.7 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  29.36 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.7 
 
 		 409 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  29.34 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  31.38 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  31.6 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  26.67 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  27.7 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  27.7 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  27.7 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  27.7 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  27.7 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  27.7 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  32.96 
 
 		 487 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.46 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  29.43 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.66 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  31.25 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  29.23 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  29.23 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  31.36 
 
 		 432 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  27.21 
 
 		 408 aa  122  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  29.34 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  32.73 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  30.91 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  30.39 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  29.34 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  29.85 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>