218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1252 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1035    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  69.02 
 
 		 486 aa  711    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  67.09 
 
 		 473 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  59.17 
 
 		 480 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  58.33 
 
 		 480 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  57.5 
 
 		 480 aa  599  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  58.58 
 
 		 482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  58.61 
 
 		 478 aa  580  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  60.92 
 
 		 477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  54.58 
 
 		 480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  58.42 
 
 		 484 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  55.72 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  56.67 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  59.38 
 
 		 477 aa  548  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  54.37 
 
 		 484 aa  546  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  52.73 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  57.32 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  53.12 
 
 		 498 aa  537  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  54.73 
 
 		 486 aa  538  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  53.75 
 
 		 484 aa  536  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  57.56 
 
 		 477 aa  531  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  54.47 
 
 		 486 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  53.54 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  51.67 
 
 		 486 aa  519  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  53.56 
 
 		 488 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  51.88 
 
 		 484 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  51.36 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  52.08 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  51.78 
 
 		 477 aa  514  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  53.15 
 
 		 460 aa  508  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  50.52 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  50.73 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  50.42 
 
 		 485 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  51.67 
 
 		 480 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  49.17 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  49.69 
 
 		 493 aa  487  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  50.94 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  48.25 
 
 		 486 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  51.16 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  48.04 
 
 		 486 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  50.84 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  51.68 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  49.3 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.25 
 
 		 514 aa  472  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  48.54 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  49.58 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  49.16 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  54.43 
 
 		 963 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  48.74 
 
 		 476 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  50.94 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  51.35 
 
 		 487 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  48.6 
 
 		 472 aa  463  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  50.73 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  50.21 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  48.9 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.16 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  48.65 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  48.01 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  54.76 
 
 		 988 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  48.03 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  53.42 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  49.46 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  49.48 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  47.91 
 
 		 476 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  49.16 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  50.63 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  49.38 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  49.89 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  50.42 
 
 		 472 aa  425  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  50.11 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  46.44 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  49.38 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  47.19 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  43.76 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  42.54 
 
 		 447 aa  335  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  39.13 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  34.35 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  31.88 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.79 
 
 		 514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  30.75 
 
 		 384 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  28.98 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  28.06 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  31.96 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  30.37 
 
 		 511 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  27.62 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  31.14 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  29.96 
 
 		 395 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.76 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.35 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  30.07 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  31.32 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  29.54 
 
 		 395 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.05 
 
 		 384 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  30.52 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  29.45 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  30.56 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  30.75 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  30.98 
 
 		 408 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  30.63 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  29.58 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>