221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0289 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  92.88 
 
 		 388 aa  731    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  93.14 
 
 		 388 aa  733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  778    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  75.07 
 
 		 379 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  75.07 
 
 		 379 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  75.07 
 
 		 379 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  75.33 
 
 		 379 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  75.07 
 
 		 379 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  61.54 
 
 		 379 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  61.27 
 
 		 379 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  58.2 
 
 		 373 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  57.87 
 
 		 379 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  57.67 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  54.64 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  53.58 
 
 		 382 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  53.3 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  91.95 
 
 		 188 aa  332  6e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  46.89 
 
 		 410 aa  328  8e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  42.7 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  36.74 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  40.59 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  40.05 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  38.02 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  29.13 
 
 		 443 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  30.16 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  29.56 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00230  hypothetical protein  95.59 
 
 		 88 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00233  hypothetical protein  95.59 
 
 		 88 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  31.31 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0280  release factor H-coupled RctB family protein  94.2 
 
 		 84 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  32.2 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  29.66 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  30.96 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  30.65 
 
 		 466 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  31.28 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  29.87 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  30.52 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  28.67 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  28.76 
 
 		 474 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  25 
 
 		 451 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.15 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  29.63 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.69 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  28.6 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.63 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  28.83 
 
 		 480 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  28.33 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  28.54 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  28.31 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  28.73 
 
 		 486 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  29.48 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  28.93 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  29.25 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  31.12 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  28.51 
 
 		 477 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.37 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  27.75 
 
 		 465 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  28.94 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  26.22 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  29.38 
 
 		 463 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  28.85 
 
 		 486 aa  123  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  27.6 
 
 		 488 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  27.93 
 
 		 488 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  29.37 
 
 		 407 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  28.15 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  28.25 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  30.15 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.33 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  28.47 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  28.33 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  30.75 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  29.7 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  30.05 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  28.5 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  28.16 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  28.97 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  29.14 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  29.66 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  28.12 
 
 		 408 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  30.26 
 
 		 470 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  28.12 
 
 		 408 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  30.58 
 
 		 477 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  27.94 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  28.89 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  27.38 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  28.99 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  27.38 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  27.38 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  28.82 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  28.96 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  28.57 
 
 		 405 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  29.38 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  29.84 
 
 		 484 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  29.38 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  27.4 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  27.38 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  27.38 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  29.41 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  28.88 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>