217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5608 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  100 
 
 
511 aa  1025    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  44.53 
 
 
514 aa  403  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  33.12 
 
 
472 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  33.08 
 
 
463 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  31.66 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  31.14 
 
 
466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  31.24 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  29.54 
 
 
474 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  32.74 
 
 
498 aa  179  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  31.84 
 
 
486 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  32.08 
 
 
484 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  32.34 
 
 
484 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  31.75 
 
 
480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  29.54 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  30.34 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  32.81 
 
 
482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  27.93 
 
 
443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  32.42 
 
 
486 aa  173  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  31.12 
 
 
480 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  32.03 
 
 
473 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  31.16 
 
 
480 aa  169  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  31.52 
 
 
473 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  29.71 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  31.62 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  30.96 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  35.15 
 
 
478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  31.89 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  35.98 
 
 
487 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  33.11 
 
 
477 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  35.98 
 
 
487 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  30.86 
 
 
486 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  31.62 
 
 
481 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  28.13 
 
 
472 aa  160  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  33 
 
 
465 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  35.54 
 
 
488 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  33.26 
 
 
477 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  30.13 
 
 
484 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  30.37 
 
 
500 aa  158  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  31.12 
 
 
477 aa  158  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  31.7 
 
 
484 aa  157  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  31.59 
 
 
486 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  30.66 
 
 
486 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  31.08 
 
 
460 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  30.08 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  32.32 
 
 
479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  30.45 
 
 
473 aa  154  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  32.27 
 
 
476 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  31.34 
 
 
476 aa  154  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  30.74 
 
 
488 aa  153  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  28.85 
 
 
462 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  32.49 
 
 
476 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  29.83 
 
 
502 aa  151  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  34.66 
 
 
480 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  30.95 
 
 
477 aa  149  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  33.47 
 
 
475 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  31.65 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  28.27 
 
 
963 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  32.71 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  33.2 
 
 
472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  28.6 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  34.15 
 
 
484 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  29.94 
 
 
488 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  29.13 
 
 
485 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  33.26 
 
 
476 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  33.27 
 
 
477 aa  144  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  29.65 
 
 
477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  34.23 
 
 
432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  29.43 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  30.12 
 
 
476 aa  140  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  33.19 
 
 
477 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  28.16 
 
 
475 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  31.38 
 
 
988 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  29.09 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  28.1 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  29.53 
 
 
476 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  29.53 
 
 
486 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  29.72 
 
 
486 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  32.68 
 
 
476 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  32.53 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  28.54 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  29.86 
 
 
493 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  34.67 
 
 
475 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  27.58 
 
 
392 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.07 
 
 
395 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  29.82 
 
 
485 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  29.45 
 
 
379 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  29.77 
 
 
407 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  29.87 
 
 
379 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  29.45 
 
 
379 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  28.91 
 
 
388 aa  124  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  29.45 
 
 
379 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29.43 
 
 
402 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  31.58 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  29.77 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  28.69 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  30.02 
 
 
411 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  29.23 
 
 
379 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  30.45 
 
 
379 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  28.57 
 
 
408 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  29.32 
 
 
398 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>