31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00233 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00230  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00233  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0280  release factor H-coupled RctB family protein  98.81 
 
 		 84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  97.22 
 
 		 388 aa  152  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  97.22 
 
 		 388 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  95.59 
 
 		 379 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  94.2 
 
 		 188 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  79.71 
 
 		 379 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  79.71 
 
 		 379 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  79.71 
 
 		 379 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  79.71 
 
 		 379 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  79.71 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  75 
 
 		 379 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  75 
 
 		 379 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  63.24 
 
 		 392 aa  97.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  66.67 
 
 		 379 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  66.18 
 
 		 373 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  66.18 
 
 		 373 aa  95.9  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  65.62 
 
 		 384 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  55.07 
 
 		 382 aa  83.6  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  59.26 
 
 		 410 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  53.23 
 
 		 396 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  50 
 
 		 395 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  44.44 
 
 		 357 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  47.62 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  38.24 
 
 		 447 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  44.23 
 
 		 443 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  38.46 
 
 		 407 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  41.67 
 
 		 486 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  47.83 
 
 		 465 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  52.63 
 
 		 477 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>