220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01749 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  772    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  69.66 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  69.39 
 
 		 379 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  65.43 
 
 		 373 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  64.1 
 
 		 373 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  64.83 
 
 		 382 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  61.7 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  61.97 
 
 		 379 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  61.7 
 
 		 379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  61.44 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  61.44 
 
 		 379 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  57.87 
 
 		 379 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  57.6 
 
 		 388 aa  431  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  57.6 
 
 		 388 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  54.62 
 
 		 392 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  54.08 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  47.16 
 
 		 410 aa  348  7e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  45.55 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  37.64 
 
 		 357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  43.13 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  41.73 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  42.97 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  58.62 
 
 		 188 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  28.51 
 
 		 472 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.41 
 
 		 466 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  32.28 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  32.41 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  27.63 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  30.48 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  33.07 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  31.83 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  30.02 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  30.71 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  31.44 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  30.88 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  30.88 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  30.56 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  30.88 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  31 
 
 		 486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  28.77 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  30.88 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  31.13 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  30.88 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  31.19 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  30.88 
 
 		 408 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  30.49 
 
 		 465 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  31.08 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  31.19 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  32.17 
 
 		 472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.9 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  33.78 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  32.07 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  29.85 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  30.64 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  32.88 
 
 		 487 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.31 
 
 		 395 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  30.12 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  29.78 
 
 		 430 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  29.06 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  29.53 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  28.36 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  26.93 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  29.95 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  28.77 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  30.39 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.43 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  31.11 
 
 		 478 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  29.06 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  30.02 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  28.97 
 
 		 474 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  28.77 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  30.26 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  31.73 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  33.56 
 
 		 488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  28.54 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  30.49 
 
 		 486 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  32 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  29.07 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  30.67 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  30.54 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  30.45 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.83 
 
 		 398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  32.66 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  29.73 
 
 		 500 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  32.19 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  27.21 
 
 		 480 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  30.1 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.83 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  27.5 
 
 		 482 aa  126  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  29.95 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  29.97 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  31.22 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  31.88 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  31.29 
 
 		 477 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.69 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  27.11 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  29.35 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29.88 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  26.24 
 
 		 480 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  29.13 
 
 		 484 aa  123  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>