221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1125 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1125  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  759    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3283  release factor H-coupled RctB family protein  48.67 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.812621  normal  0.065367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  48.19 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  46.15 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  42.7 
 
 		 392 aa  292  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  48.19 
 
 		 379 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3596  hypothetical protein  43.01 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3438  hypothetical protein  42.74 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  45.55 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0331  hypothetical protein  41.42 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0728371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  44.23 
 
 		 379 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  43.96 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  43.96 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  43.96 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0289  hypothetical protein  42.7 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  43.68 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  45.53 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0262  hypothetical protein  42.38 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0267  hypothetical protein  42.38 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0241  hypothetical protein  43.86 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0759  release factor H-coupled RctB family protein  36.46 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2040  hypothetical protein  43.54 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.943911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  33.08 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0231  putative release factor H-coupled RctB family protein  41.67 
 
 		 188 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  32.26 
 
 		 463 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  28.47 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  32.84 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  26.35 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.38 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  30.52 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  36.23 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  27.6 
 
 		 474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  35.23 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  27.27 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  29.06 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  28.57 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  32.16 
 
 		 385 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  29.54 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  30.14 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  34.22 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  30.37 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  29.44 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  29.64 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  28.6 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  26.97 
 
 		 480 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  29.95 
 
 		 484 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  32.64 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.2 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.39 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  25.78 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  29.57 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  26.68 
 
 		 480 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  26.68 
 
 		 480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  29.04 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  29.97 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  29.23 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  28.33 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  27.32 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  29.06 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  28.81 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.54 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  29.87 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  29.18 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  30.43 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  28.57 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  28.37 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  28.15 
 
 		 473 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  28.43 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  28.5 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  30.63 
 
 		 508 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  27.86 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  28.33 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  28.33 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.06 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  28.05 
 
 		 486 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  28.33 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  28.33 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  27.75 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  28.6 
 
 		 477 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  30.75 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  28.1 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  29.48 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  28.27 
 
 		 477 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  28.12 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  27.51 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  26.65 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  29.95 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  28.12 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  30.9 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  29.95 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  29.25 
 
 		 404 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  26.97 
 
 		 484 aa  102  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  28.97 
 
 		 463 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  27.5 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  29.06 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  29.83 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  29.3 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  29.92 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  28.18 
 
 		 963 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>