218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3740 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 466 aa  960    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  95.71 
 
 		 466 aa  921    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  58.58 
 
 		 463 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  57.63 
 
 		 472 aa  535  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.71 
 
 		 514 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  31.66 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  30.95 
 
 		 480 aa  179  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  31.91 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  31.98 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  30.8 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  30.94 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  31.12 
 
 		 475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  32.17 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  33.03 
 
 		 482 aa  163  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  33.26 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  29.96 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  33.03 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  32.65 
 
 		 484 aa  160  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  31.43 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  29.75 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  28.48 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  30.02 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  29.82 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  30.38 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  27.62 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  32.12 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  28.93 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  31.47 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  32.11 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  28.46 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  29.45 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  30.72 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  30.34 
 
 		 514 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  29.89 
 
 		 486 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  30.91 
 
 		 409 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  29.24 
 
 		 476 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  31.74 
 
 		 406 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  29.6 
 
 		 486 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  29.34 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  30.41 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  32.49 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  29.68 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  29.9 
 
 		 502 aa  146  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  30.95 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.95 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.95 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72210  hypothetical protein  31.64 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  29.49 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.07 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  28.75 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  31.31 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  30.48 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  30.51 
 
 		 477 aa  143  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  30.16 
 
 		 430 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  29.31 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6268  hypothetical protein  32.49 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  30.48 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  30.5 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  29.1 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  29.73 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  29.73 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  32.41 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  30.61 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  29.95 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  28.69 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  32.74 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  31.9 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  30.29 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  30.11 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  29.5 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  28.4 
 
 		 488 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.28 
 
 		 408 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  29.57 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  29.28 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  31.48 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  27.97 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  29.84 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  29.57 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  27.75 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  31.66 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  28.4 
 
 		 488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  31.97 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  28.47 
 
 		 963 aa  137  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  30.38 
 
 		 476 aa  137  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  36.39 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  27.2 
 
 		 462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  27.75 
 
 		 477 aa  136  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  29.71 
 
 		 398 aa  136  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  29.91 
 
 		 407 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  29.91 
 
 		 407 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  30.66 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  31.36 
 
 		 477 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  28.89 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.25 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  30.75 
 
 		 487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  30.66 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  30.84 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  29.19 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  29.39 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  27.47 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>