216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2726 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  73.2 
 
 		 485 aa  757    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  71.46 
 
 		 486 aa  742    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  71.88 
 
 		 486 aa  743    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  74.11 
 
 		 485 aa  755    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  1014    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  65.34 
 
 		 485 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  74.11 
 
 		 485 aa  776    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  55.39 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  51.56 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  52.5 
 
 		 478 aa  488  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  48.54 
 
 		 480 aa  490  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  48.95 
 
 		 480 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  52.59 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  48.54 
 
 		 480 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  49.69 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  49.27 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  51.46 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  51.35 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  51.55 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  50.94 
 
 		 486 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  49.38 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  52.38 
 
 		 484 aa  477  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  49.79 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  49.9 
 
 		 486 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  46.36 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  50 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  48.34 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  48.35 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  51.27 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  51.14 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  50.21 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  49.46 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  48.76 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  47.93 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  48.45 
 
 		 477 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  48.02 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  45.68 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  48.13 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  46.67 
 
 		 482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  47.82 
 
 		 476 aa  448  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  47.82 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  47.31 
 
 		 486 aa  450  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  49.48 
 
 		 476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  47.52 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  49.48 
 
 		 477 aa  445  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  47.52 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  49.07 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  50.84 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  49.48 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  48.54 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  48.04 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  48.09 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  47.93 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  49.27 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  46.31 
 
 		 502 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  45.9 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  45.82 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  45.05 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  47.68 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  49.66 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  48.37 
 
 		 484 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  50.11 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  45.77 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  48.86 
 
 		 472 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  48.85 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  46.19 
 
 		 487 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  45.98 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  50.38 
 
 		 988 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  45.45 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  45.69 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  45.15 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  44.59 
 
 		 963 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  46.79 
 
 		 475 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  38.93 
 
 		 462 aa  325  8.000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  39.87 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  30.9 
 
 		 451 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.85 
 
 		 396 aa  160  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  30.37 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.77 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  31.61 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  30.28 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  31.22 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  28.91 
 
 		 395 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.44 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.24 
 
 		 398 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  28.44 
 
 		 408 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  27.92 
 
 		 384 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  27.97 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  30.3 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  29.75 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  28.34 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  28.19 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  28.2 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  28.2 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  28.54 
 
 		 508 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  28.2 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  28.9 
 
 		 393 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  28.2 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  29.16 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>