215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1684 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  1008    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  88.87 
 
 		 485 aa  917    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  75.51 
 
 		 486 aa  772    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  73.2 
 
 		 493 aa  757    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  72.58 
 
 		 485 aa  761    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  82.06 
 
 		 485 aa  845    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  75.93 
 
 		 486 aa  773    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  52.9 
 
 		 480 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  52.7 
 
 		 480 aa  512  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  52.28 
 
 		 484 aa  505  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  52.77 
 
 		 482 aa  502  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  52.28 
 
 		 480 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  50.42 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  50 
 
 		 480 aa  488  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  51.76 
 
 		 484 aa  488  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  50.72 
 
 		 484 aa  481  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  50.93 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  50.93 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  50.93 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  52.49 
 
 		 486 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  49.38 
 
 		 486 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  51.19 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  50.1 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  49.06 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  49.9 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  49.69 
 
 		 486 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  48.44 
 
 		 486 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  49.48 
 
 		 476 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  49.28 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  48.35 
 
 		 486 aa  457  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  50.21 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  48.86 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  48.86 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  48.75 
 
 		 473 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  48.33 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  45.53 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  48.44 
 
 		 481 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  47.51 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  47.51 
 
 		 474 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  47.92 
 
 		 475 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  47.73 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  47.4 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  47.61 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  48.65 
 
 		 476 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  46.09 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  48.1 
 
 		 477 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  49.58 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  46.9 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  47.83 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  48.31 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  47.41 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  46.89 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  47.61 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  47.29 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  47.15 
 
 		 476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  45.31 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  44.51 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.51 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  48.07 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  44.77 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  48.2 
 
 		 963 aa  384  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  49.75 
 
 		 988 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  45.57 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  45.77 
 
 		 487 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  46.95 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  45.15 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  45.93 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  47.1 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  42.86 
 
 		 478 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  46.01 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  46.97 
 
 		 472 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  44.33 
 
 		 479 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  43.78 
 
 		 473 aa  349  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  45.13 
 
 		 475 aa  332  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  37.93 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  36.79 
 
 		 462 aa  280  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  31.67 
 
 		 451 aa  216  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.43 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  29.71 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.35 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  30.68 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  32.23 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  30.93 
 
 		 384 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  28.37 
 
 		 372 aa  143  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  31.68 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  31.68 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  29.84 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  29.18 
 
 		 408 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  28.95 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  28.15 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  29.95 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.72 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  29.35 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.92 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.09 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.18 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  28.73 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  28.73 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  28.73 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  28.73 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>