218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2399 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  934    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  88.35 
 
 		 472 aa  780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  70.97 
 
 		 465 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  71.04 
 
 		 475 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  67.05 
 
 		 432 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  50.42 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  49.58 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  52.21 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  49.38 
 
 		 486 aa  468  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  52.73 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  48.74 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  48.74 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  51.05 
 
 		 477 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  47.47 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  51.95 
 
 		 482 aa  455  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  53.57 
 
 		 486 aa  455  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  49.37 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  52.29 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  53.59 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  49.47 
 
 		 476 aa  448  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  54.04 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  47.06 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  50.1 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  48.02 
 
 		 482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  49.47 
 
 		 476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  49.58 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  51.58 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  50.21 
 
 		 486 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  47.65 
 
 		 474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  51.32 
 
 		 477 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  47.48 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  45.61 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  54.19 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  48.81 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  53.98 
 
 		 476 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  51.88 
 
 		 477 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  53.7 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  48.31 
 
 		 486 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  54.01 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  53.21 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  49.47 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  48.86 
 
 		 493 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  48.7 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  48.7 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.37 
 
 		 481 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  52.24 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  51.59 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  47.84 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  48.12 
 
 		 486 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  53.18 
 
 		 484 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  52.59 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  48.92 
 
 		 484 aa  418  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  47.92 
 
 		 486 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  48.9 
 
 		 477 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  47.6 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  47.89 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  48.31 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  47.39 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  52.07 
 
 		 476 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  46.97 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  46.57 
 
 		 485 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  47.02 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  46.98 
 
 		 484 aa  397  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  51.48 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  51.48 
 
 		 487 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  51.27 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  41.13 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  51.05 
 
 		 479 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  47.39 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  52.31 
 
 		 988 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  45.72 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  46.76 
 
 		 514 aa  378  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  38.59 
 
 		 963 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  43.22 
 
 		 478 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  39.32 
 
 		 462 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  41.49 
 
 		 447 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  31.81 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  34.01 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  30.67 
 
 		 514 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  34.25 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  33.26 
 
 		 398 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  35.02 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.8 
 
 		 384 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  33.86 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  33.85 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  29.12 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  34.74 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  33.26 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  29.8 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.37 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  34.01 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  33.26 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  34.34 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  32.1 
 
 		 395 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  31.88 
 
 		 410 aa  146  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.55 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  30.63 
 
 		 466 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  34.1 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.22 
 
 		 404 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>