216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1619 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  88.87 
 
 		 485 aa  917    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  76.75 
 
 		 486 aa  779    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  1008    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  74.11 
 
 		 493 aa  755    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  72.16 
 
 		 485 aa  755    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  76.95 
 
 		 486 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  83.3 
 
 		 485 aa  853    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  52.07 
 
 		 484 aa  511  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  52.39 
 
 		 482 aa  502  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  50.41 
 
 		 480 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  50.21 
 
 		 480 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  51.35 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  49.17 
 
 		 500 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  50.93 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  51.14 
 
 		 498 aa  488  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  49.79 
 
 		 480 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  50.52 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  51.88 
 
 		 486 aa  478  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  51.14 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  47.71 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  49.38 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  47.94 
 
 		 486 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  51.04 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  48.77 
 
 		 486 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  50.11 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  48.97 
 
 		 486 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  48.65 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  49.9 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  48.23 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  48.24 
 
 		 476 aa  455  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  47.52 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  48.96 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  47.92 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  44.91 
 
 		 482 aa  443  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  46.82 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  48.14 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  47.82 
 
 		 477 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  47.3 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  46.99 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  47.4 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  47.51 
 
 		 477 aa  435  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  48.65 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  47.4 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  48.65 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  45.52 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  49.38 
 
 		 475 aa  425  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  45.45 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  47.51 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  45.87 
 
 		 488 aa  418  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  45.95 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  47.46 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  47.08 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  47.52 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  46.51 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  45.95 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  45.88 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  44.85 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  43.91 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  44.09 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  48.07 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  44.74 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  45.15 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  45.15 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  47.16 
 
 		 963 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  45.26 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  46.91 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  46.89 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  45.32 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  47.39 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  45.15 
 
 		 479 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  48.48 
 
 		 988 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  42.17 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  43.13 
 
 		 473 aa  353  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  45.45 
 
 		 475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  37.12 
 
 		 462 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  38.2 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  31.1 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.79 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.5 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  30.33 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.17 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  29.49 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  28.81 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.39 
 
 		 398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  29.49 
 
 		 384 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  29.43 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  29.77 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  28.85 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  30.52 
 
 		 470 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  28.95 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.05 
 
 		 404 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  28.76 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  26.5 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  28.73 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.06 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  29.82 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  28.73 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  28.73 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  28.73 
 
 		 408 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  28.73 
 
 		 408 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>