216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0333 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 476 aa  962    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  60.38 
 
 		 477 aa  589  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  58.82 
 
 		 476 aa  585  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  58.61 
 
 		 476 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  57.98 
 
 		 477 aa  584  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  60.59 
 
 		 477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  60.5 
 
 		 476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  58.07 
 
 		 475 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  60.29 
 
 		 476 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  60.92 
 
 		 476 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  59.87 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  59.87 
 
 		 475 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  59.03 
 
 		 476 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  51.88 
 
 		 500 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  51.88 
 
 		 486 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  51.34 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  52.53 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  50.52 
 
 		 498 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  47.81 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  50.42 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  48.02 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  49.28 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  49.26 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  47.6 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  49.26 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  51.15 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  49.48 
 
 		 493 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  49.9 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  50.32 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  51.15 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  50.74 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  46.6 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  49.58 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  51.9 
 
 		 486 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  49.38 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  48.34 
 
 		 486 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  49.02 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  48.55 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  46.97 
 
 		 482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  48.65 
 
 		 485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  48.65 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  49.58 
 
 		 486 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  48.45 
 
 		 485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  48.54 
 
 		 486 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  49.89 
 
 		 478 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  47.61 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  44.59 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  45.97 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.37 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  50.94 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  50.53 
 
 		 477 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  48.02 
 
 		 484 aa  438  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  48.41 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  47.38 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  51.04 
 
 		 484 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  47.19 
 
 		 488 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  48.42 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  53.92 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  45.96 
 
 		 488 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  52.45 
 
 		 472 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  51.5 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  50.21 
 
 		 487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  52.24 
 
 		 472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  49.38 
 
 		 479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  50.62 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  43.35 
 
 		 443 aa  405  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  50 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  44.38 
 
 		 502 aa  396  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.07 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  50.12 
 
 		 988 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  42.97 
 
 		 963 aa  375  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  52.12 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  45.68 
 
 		 473 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  42.77 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  40 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  39.96 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  29.23 
 
 		 451 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  31.77 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.84 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  32.24 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  31.36 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  30.13 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  30.32 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  30.32 
 
 		 408 aa  150  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  30.24 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.02 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  31.53 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  30.09 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  30.11 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  29.37 
 
 		 408 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.86 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  29.86 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  29.86 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  29.86 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  29.86 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  29.89 
 
 		 466 aa  147  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  29.31 
 
 		 404 aa  147  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  31 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  30.92 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  31.22 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>