218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3119 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  70.8 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  66.32 
 
 		 389 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  66.07 
 
 		 390 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  62.21 
 
 		 385 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  49.49 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  48.04 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  47.37 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  48.45 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  46.65 
 
 		 408 aa  352  8e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  46.91 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  46.91 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  46.65 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  46.65 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  47.95 
 
 		 409 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  46.65 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  46.65 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  47.41 
 
 		 411 aa  349  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  46.74 
 
 		 405 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  45.76 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  46.48 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  46.39 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  48.03 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  46.13 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  46.89 
 
 		 411 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  46.88 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  47.78 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  48.03 
 
 		 404 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  46.63 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  47.52 
 
 		 409 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  45.45 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  47.41 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  47.14 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  45.89 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  46.38 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  46.15 
 
 		 410 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  47.01 
 
 		 408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  46.21 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  45.89 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  46.51 
 
 		 430 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  47.42 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  45.89 
 
 		 407 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  45.89 
 
 		 407 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  44.9 
 
 		 393 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  46.21 
 
 		 412 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  44.99 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  44.42 
 
 		 411 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  44.1 
 
 		 409 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  47.33 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  45.38 
 
 		 384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  44.7 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  45.27 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  44.64 
 
 		 398 aa  301  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  43.98 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  44.65 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  45.57 
 
 		 409 aa  290  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  44.65 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  45.69 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  45.05 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  41.98 
 
 		 410 aa  278  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  45.18 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  43.65 
 
 		 715 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  43.65 
 
 		 715 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  40.72 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  40.11 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  34.99 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  35.71 
 
 		 470 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  32.38 
 
 		 379 aa  173  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  29.1 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  34.82 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  29.95 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  29.95 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  29.95 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  29.5 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  29.5 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  31.44 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  32.55 
 
 		 463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  29.69 
 
 		 395 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  29.69 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  31.8 
 
 		 498 aa  163  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  30.27 
 
 		 484 aa  162  9e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  32.72 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  31.34 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  34.91 
 
 		 474 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  33.77 
 
 		 473 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  31.34 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  30.37 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  34.54 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  29.72 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  32.1 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  30.25 
 
 		 462 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  32.23 
 
 		 462 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.44 
 
 		 470 aa  156  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  30.6 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  31.08 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  30.32 
 
 		 473 aa  152  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  31.07 
 
 		 482 aa  152  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  32.67 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  33.8 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>