203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1051 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1011  hypothetical protein  69.88 
 
 		 510 aa  739    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1051  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1050    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.738167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  30.54 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  28.04 
 
 		 473 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  31.13 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  29.23 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  31.09 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  30.24 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  29.5 
 
 		 484 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  30.12 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  30.47 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  30.36 
 
 		 508 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  30.34 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  30.88 
 
 		 474 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  29.91 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  26.47 
 
 		 402 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  24.59 
 
 		 411 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  26.43 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  23.89 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  25.37 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  24.75 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  26.83 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  26.56 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  27.46 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  25.96 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  25.81 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  25.57 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  26.49 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  26.38 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  27.86 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  27.23 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  28.27 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  25.42 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  24.76 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  26.12 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  28.25 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  27.4 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  24.19 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  26.28 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  25.32 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  25.48 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  25.55 
 
 		 393 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  26.49 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  27.78 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0873  hypothetical protein  25.06 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250063  hitchhiker  0.0000000169408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  27.01 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  23.82 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4254  protein of unknown function UPF0027  22.22 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  25.47 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  24.76 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  24.17 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  24.26 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  26.64 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  25.84 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  27.4 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  26.64 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  26.11 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  24.63 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  25.88 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  25.81 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  25.87 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  24.3 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  25.65 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  28.99 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  25.65 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  28.91 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  24.02 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  25.06 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  26.11 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  26.11 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  24.08 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  26.96 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  22.73 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  22.73 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  23.06 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  23.06 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  30.13 
 
 		 988 aa  70.1  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  27.17 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  25.29 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  23.82 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  23.3 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  24.82 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  23.93 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  25.46 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  24.95 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  24.75 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  23.41 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  26.58 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  23.96 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  22.37 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  25.55 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  24.94 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  22.81 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  25.15 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  24.19 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  25.08 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  23.52 
 
 		 498 aa  67  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2460  release factor H-coupled RctB family protein  26.04 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  23.11 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>