86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02473 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 848 aa  1696    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  69.44 
 
 		 3322 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  52.08 
 
 		 915 aa  601  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.15 
 
 		 3475 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  44.41 
 
 		 710 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2213  hypothetical protein  52.35 
 
 		 453 aa  220  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153611  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2219  putative hemagglutinin-related protein  51.62 
 
 		 455 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0473724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  39.24 
 
 		 1998 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.16 
 
 		 3862 aa  172  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  38.21 
 
 		 3552 aa  152  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  37.87 
 
 		 3501 aa  151  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  36.42 
 
 		 2984 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  38.25 
 
 		 3004 aa  145  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.52 
 
 		 3079 aa  142  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  35.93 
 
 		 3165 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.05 
 
 		 3602 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  47.75 
 
 		 3147 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  34.25 
 
 		 2061 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.15 
 
 		 3790 aa  132  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  46.63 
 
 		 3159 aa  131  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  45.77 
 
 		 3526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  47.34 
 
 		 3144 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.95 
 
 		 2345 aa  129  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  41.18 
 
 		 3301 aa  128  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  47.34 
 
 		 3131 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.85 
 
 		 3028 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.93 
 
 		 2782 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  48.52 
 
 		 857 aa  125  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  46.75 
 
 		 3141 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.75 
 
 		 3796 aa  124  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.47 
 
 		 3967 aa  122  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  42.61 
 
 		 3081 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.34 
 
 		 3020 aa  121  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.76 
 
 		 2600 aa  120  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.6 
 
 		 3128 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.31 
 
 		 2545 aa  119  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  30.68 
 
 		 2530 aa  118  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  45.35 
 
 		 1038 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  30.5 
 
 		 2588 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  43.93 
 
 		 5981 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.79 
 
 		 3040 aa  113  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  49.16 
 
 		 3141 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.59 
 
 		 4966 aa  110  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  40.49 
 
 		 3884 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.69 
 
 		 3785 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  48.6 
 
 		 3141 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1521  hypothetical protein  42.23 
 
 		 397 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  41.04 
 
 		 763 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1052 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1077 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  29.57 
 
 		 3300 aa  95.1  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1746  hypothetical protein  29.29 
 
 		 683 aa  94.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0518263  hitchhiker  0.0000860028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  37.08 
 
 		 412 aa  87.4  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1985  hypothetical protein  33.04 
 
 		 483 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1268 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  35.44 
 
 		 3350 aa  85.9  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.36 
 
 		 2670 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2794  hypothetical protein  34.73 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2210  putative cytoplasmic protein  35.1 
 
 		 588 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  unclonable  1.13834e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3036  putative cytoplasmic protein  44.55 
 
 		 135 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 3378 aa  75.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 3480 aa  75.5  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  35.58 
 
 		 615 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02476  hypothetical protein  77.5 
 
 		 45 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934646  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0054  hypothetical protein  26.92 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.369318  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1393  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2309  hypothetical protein  41.82 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.432241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  28.52 
 
 		 3563 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  28.52 
 
 		 980 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  29.24 
 
 		 5212 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  37.57 
 
 		 2827 aa  65.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  32.7 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  31.9 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  31.29 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2212  putative cytoplasmic protein  36.36 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000235333  hitchhiker  2.3052800000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  30.32 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2790  hypothetical protein  30.69 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2788  hypothetical protein  30.2 
 
 		 381 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1391  hemagglutinin-like secreted protein  37.65 
 
 		 267 aa  57  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2211  hypothetical protein  31.43 
 
 		 376 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  32.14 
 
 		 1489 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1195  hypothetical protein  33.96 
 
 		 114 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2840  hypothetical protein  35.85 
 
 		 114 aa  51.6  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00994271  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1321  hypothetical protein  31.47 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0254771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0577  putative adhesin  40.45 
 
 		 599 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0519  hypothetical protein  40.45 
 
 		 640 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.891503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>