279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2040 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.61 
 
 		 1281 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  34.06 
 
 		 1723 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  40.81 
 
 		 1632 aa  997    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  36.65 
 
 		 1290 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.3 
 
 		 1283 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  55.25 
 
 		 982 aa  929    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  42.24 
 
 		 1562 aa  991    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1682 aa  3489    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  41.83 
 
 		 1578 aa  999    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  33.57 
 
 		 1689 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  38.4 
 
 		 1658 aa  894    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  30.66 
 
 		 1312 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1698 aa  362  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  25.2 
 
 		 1669 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1559 aa  248  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1230 aa  220  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  22.04 
 
 		 1267 aa  169  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0986  hypothetical protein  25.53 
 
 		 725 aa  152  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  43.48 
 
 		 359 aa  145  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  44.64 
 
 		 363 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  47.56 
 
 		 331 aa  138  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  43.45 
 
 		 380 aa  132  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  41.07 
 
 		 371 aa  132  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  41.42 
 
 		 352 aa  130  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  40.48 
 
 		 332 aa  127  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  41.07 
 
 		 338 aa  127  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  39.01 
 
 		 348 aa  117  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  37.65 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  45.76 
 
 		 344 aa  108  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  35.62 
 
 		 322 aa  108  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  41.84 
 
 		 316 aa  108  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  39.6 
 
 		 317 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.48 
 
 		 1572 aa  106  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.92 
 
 		 1586 aa  105  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.92 
 
 		 1595 aa  105  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  41.38 
 
 		 314 aa  104  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  36.87 
 
 		 401 aa  103  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  38.03 
 
 		 303 aa  102  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  51.96 
 
 		 264 aa  102  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  68.25 
 
 		 265 aa  101  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  38.89 
 
 		 300 aa  99  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  43.48 
 
 		 312 aa  95.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  46.79 
 
 		 265 aa  95.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  51.72 
 
 		 263 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.91 
 
 		 1576 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0987  hypothetical protein  24.62 
 
 		 506 aa  94.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  51.19 
 
 		 262 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  56.25 
 
 		 295 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.19 
 
 		 1614 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.18 
 
 		 1942 aa  90.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1623 aa  89.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.79 
 
 		 3027 aa  89  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  53.57 
 
 		 218 aa  89  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  50.52 
 
 		 246 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.25 
 
 		 2096 aa  88.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  46.08 
 
 		 274 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  46.74 
 
 		 249 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  40.94 
 
 		 237 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  31.21 
 
 		 322 aa  86.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  48.81 
 
 		 240 aa  86.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1917 aa  86.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  33.57 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  48.75 
 
 		 265 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1840 aa  84  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  45.36 
 
 		 263 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  42.7 
 
 		 378 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  47.5 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  46.43 
 
 		 207 aa  81.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  44.76 
 
 		 243 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  45.45 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1763 aa  77.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1669 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 927 aa  76.3  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1433 aa  76.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  31.11 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  22.3 
 
 		 1679 aa  75.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  23.55 
 
 		 1423 aa  75.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  44.59 
 
 		 290 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.62 
 
 		 1384 aa  74.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1600 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.29 
 
 		 1599 aa  73.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.8 
 
 		 2035 aa  73.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  26.07 
 
 		 1475 aa  73.6  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  23.62 
 
 		 1457 aa  72.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.45 
 
 		 690 aa  72  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  41.35 
 
 		 275 aa  72  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1620 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 2486 aa  70.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1611 aa  70.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  23.02 
 
 		 2246 aa  68.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  24.57 
 
 		 931 aa  68.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1531 aa  68.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  22.32 
 
 		 2178 aa  68.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  24.59 
 
 		 1046 aa  67.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.22 
 
 		 1732 aa  67  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  22.87 
 
 		 2961 aa  67  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  21.99 
 
 		 2225 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>