74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0353 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  42.08 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  46.15 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  39.2 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  44.52 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  41.38 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  43.15 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  41.04 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  41.5 
 
 		 1698 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  43.15 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  42.07 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  54.55 
 
 		 378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  45.58 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  39.26 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  46.15 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  59.3 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  41.78 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  64.79 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  54 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  45.52 
 
 		 1578 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  42.48 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  38.73 
 
 		 1562 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  43.48 
 
 		 1669 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  43.15 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1682 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  39.04 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  64.18 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  40 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  45.74 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  46.09 
 
 		 122 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  53.75 
 
 		 249 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  42.2 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  53.33 
 
 		 263 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  44.23 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  47.27 
 
 		 263 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  40.94 
 
 		 982 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  59.09 
 
 		 376 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  60 
 
 		 237 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  48.89 
 
 		 218 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  42.45 
 
 		 1632 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  53.09 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  67.74 
 
 		 246 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  58.33 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  60 
 
 		 264 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  45.63 
 
 		 1723 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  42.72 
 
 		 265 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  34.72 
 
 		 322 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  48.24 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  43.69 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  44.55 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  49.38 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  43.88 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  38.39 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  38.24 
 
 		 1658 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  40.38 
 
 		 1689 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  41.75 
 
 		 1559 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1959 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  34.02 
 
 		 2277 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3013  hypothetical protein  46.03 
 
 		 83 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165053  normal  0.0429023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1917 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2680  hypothetical protein  43.75 
 
 		 66 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  30.56 
 
 		 628 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  44.44 
 
 		 2349 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  40.32 
 
 		 1840 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  37.1 
 
 		 1942 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  45.45 
 
 		 1710 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  50 
 
 		 2658 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  46.81 
 
 		 2350 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  33.33 
 
 		 902 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  51.16 
 
 		 1405 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  30.1 
 
 		 1599 aa  42.7  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  42.03 
 
 		 474 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>