118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2793 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1698 aa  3476    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  30.35 
 
 		 1578 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  29.72 
 
 		 1562 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1723 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1682 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1632 aa  361  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1281 aa  333  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1689 aa  315  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1658 aa  313  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1290 aa  291  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1312 aa  276  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1559 aa  264  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1283 aa  256  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1230 aa  224  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  26.55 
 
 		 982 aa  196  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  22.82 
 
 		 1267 aa  173  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  30.45 
 
 		 1669 aa  165  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  46.48 
 
 		 331 aa  125  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  37.65 
 
 		 371 aa  123  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  36.45 
 
 		 380 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  39.61 
 
 		 332 aa  117  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  38.41 
 
 		 363 aa  115  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  38.18 
 
 		 359 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  41.5 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  39.26 
 
 		 322 aa  112  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  48.08 
 
 		 313 aa  112  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  37.97 
 
 		 317 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  43.71 
 
 		 308 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  58.97 
 
 		 246 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  38.65 
 
 		 300 aa  104  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  37.58 
 
 		 314 aa  104  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  33.86 
 
 		 352 aa  103  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  52.81 
 
 		 263 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  50.5 
 
 		 237 aa  102  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  45.92 
 
 		 207 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  34.21 
 
 		 348 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  57.35 
 
 		 218 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  57.53 
 
 		 376 aa  96.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  59.09 
 
 		 401 aa  96.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  63.49 
 
 		 265 aa  95.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  50.55 
 
 		 249 aa  95.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  43.36 
 
 		 243 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  45.92 
 
 		 264 aa  95.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  56.94 
 
 		 122 aa  94  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  48.98 
 
 		 262 aa  93.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  54.88 
 
 		 295 aa  92.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  53.66 
 
 		 316 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0986  hypothetical protein  24.89 
 
 		 725 aa  89  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  57.58 
 
 		 378 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  48.78 
 
 		 285 aa  88.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  32.96 
 
 		 303 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  34.01 
 
 		 322 aa  86.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  53.66 
 
 		 265 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  50.6 
 
 		 290 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  46.74 
 
 		 265 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  34.87 
 
 		 275 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  43.96 
 
 		 240 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  39.1 
 
 		 312 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  38.89 
 
 		 274 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1623 aa  82.8  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  40.38 
 
 		 344 aa  80.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0987  hypothetical protein  25.65 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  35.8 
 
 		 307 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  47.95 
 
 		 257 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 3273 aa  74.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  53.97 
 
 		 263 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1840 aa  68.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  27.96 
 
 		 869 aa  67.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1917 aa  63.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.67 
 
 		 741 aa  60.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1433 aa  60.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  25.52 
 
 		 1046 aa  58.9  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  23.63 
 
 		 931 aa  56.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1628 aa  56.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.72 
 
 		 3027 aa  55.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  22.35 
 
 		 2413 aa  54.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1959 aa  55.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1763 aa  52.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.01 
 
 		 3073 aa  52.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1081 aa  52.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.35 
 
 		 1942 aa  52.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.51 
 
 		 2277 aa  52.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  34.66 
 
 		 1090 aa  52.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  24.78 
 
 		 2416 aa  51.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  27.04 
 
 		 764 aa  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1197 aa  51.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.64 
 
 		 1271 aa  51.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1834 aa  50.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  24.25 
 
 		 722 aa  50.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1390 aa  51.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.25 
 
 		 2149 aa  50.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  25.81 
 
 		 2428 aa  49.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.55 
 
 		 1485 aa  49.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1405 aa  49.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  23.76 
 
 		 2486 aa  49.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.5 
 
 		 1429 aa  48.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1147 aa  48.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.96 
 
 		 482 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1487 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>