239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1491 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1632 aa  822    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  36.28 
 
 		 1562 aa  729    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  37.49 
 
 		 1682 aa  931    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  36.66 
 
 		 1578 aa  747    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  42.64 
 
 		 1283 aa  938    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1658 aa  3430    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  30.63 
 
 		 1689 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  29.99 
 
 		 1723 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1290 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.05 
 
 		 1281 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  36.66 
 
 		 982 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1312 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 1698 aa  288  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1559 aa  185  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  24.52 
 
 		 1669 aa  169  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1230 aa  140  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0986  hypothetical protein  26.81 
 
 		 725 aa  127  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  41.57 
 
 		 363 aa  113  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  40.61 
 
 		 359 aa  108  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  39.88 
 
 		 331 aa  104  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  39.39 
 
 		 380 aa  103  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  22.77 
 
 		 1267 aa  95.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  43.27 
 
 		 371 aa  92  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  34.76 
 
 		 352 aa  89.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  42.5 
 
 		 314 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  38.62 
 
 		 308 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1834 aa  87  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.04 
 
 		 1599 aa  86.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.75 
 
 		 1271 aa  85.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  37.32 
 
 		 303 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  41.74 
 
 		 316 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  38.76 
 
 		 344 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  32.94 
 
 		 322 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  43.12 
 
 		 265 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  33.54 
 
 		 332 aa  80.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  34.94 
 
 		 338 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  36.62 
 
 		 300 aa  79.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  48.15 
 
 		 265 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  26.37 
 
 		 401 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  49.37 
 
 		 264 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  51.9 
 
 		 295 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  38.24 
 
 		 328 aa  76.3  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  35.21 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  53.85 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  56.45 
 
 		 265 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.95 
 
 		 1917 aa  75.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1352 aa  74.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  41.28 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  43.9 
 
 		 207 aa  72.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  21.93 
 
 		 3027 aa  72.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1942 aa  72  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  39.62 
 
 		 317 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.7 
 
 		 678 aa  71.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.87 
 
 		 1614 aa  71.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 869 aa  70.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  46.99 
 
 		 237 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1611 aa  69.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  48.1 
 
 		 262 aa  69.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  42.31 
 
 		 243 aa  69.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  45.24 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1157 aa  69.3  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  36.61 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1172 aa  68.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  46.59 
 
 		 246 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  43.04 
 
 		 240 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 927 aa  68.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  41.98 
 
 		 285 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.7 
 
 		 1981 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  42.35 
 
 		 249 aa  67  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.04 
 
 		 1576 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  38.37 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  40.7 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  32.56 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  23.14 
 
 		 1046 aa  65.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.02 
 
 		 2035 aa  65.9  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  45.68 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  22.03 
 
 		 1623 aa  65.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.27 
 
 		 1429 aa  65.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1669 aa  65.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  21.91 
 
 		 1976 aa  65.5  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.79 
 
 		 1586 aa  65.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1492 aa  63.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.79 
 
 		 1595 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  40.96 
 
 		 122 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.86 
 
 		 1530 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  21.88 
 
 		 1384 aa  63.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  38.46 
 
 		 274 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  29.91 
 
 		 2145 aa  63.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.2 
 
 		 2096 aa  62.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 2437 aa  62  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 3273 aa  62  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  22.66 
 
 		 1572 aa  62  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  22.76 
 
 		 1409 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 2401 aa  62  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 2283 aa  62  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1959 aa  61.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3488  YD repeat-containing protein  22.66 
 
 		 1023 aa  61.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0275829 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1825 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1825 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>