73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4027 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  37.16 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  53.12 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  51.55 
 
 		 359 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  57.32 
 
 		 363 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  55 
 
 		 218 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  31.98 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  54.55 
 
 		 371 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  61.97 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  54.02 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  57.5 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  50.93 
 
 		 332 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  44.8 
 
 		 380 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  47.46 
 
 		 237 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  53.57 
 
 		 348 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  54.76 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  61.54 
 
 		 352 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  60.87 
 
 		 331 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  49.04 
 
 		 338 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  48.35 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  50.56 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  52.44 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  47.22 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  42.62 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  50.54 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  49.43 
 
 		 285 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  53.16 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  54.17 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  54.22 
 
 		 122 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  45.87 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  48.24 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  45.65 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  48.28 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  53.95 
 
 		 1559 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  44.44 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  58.21 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  52.5 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  50 
 
 		 1562 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  60.94 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  47.5 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1632 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  53.16 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  41.41 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  45.45 
 
 		 1682 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  57.14 
 
 		 982 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  48.75 
 
 		 1578 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  47.95 
 
 		 1698 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  49.44 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  55.56 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  64.71 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  46.51 
 
 		 1669 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  53.52 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  41.25 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  40.7 
 
 		 1658 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1689 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  47.5 
 
 		 1723 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  37.31 
 
 		 2277 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  44.07 
 
 		 451 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  36.05 
 
 		 1763 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  47.83 
 
 		 2113 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  39.02 
 
 		 2585 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  39.44 
 
 		 1352 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  38.46 
 
 		 605 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  34.25 
 
 		 2075 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  47.83 
 
 		 2038 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1623 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  36.11 
 
 		 2558 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  37.68 
 
 		 2831 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31 
 
 		 1568 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  34.26 
 
 		 2513 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  32.05 
 
 		 2731 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  36.92 
 
 		 1149 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>