42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3207 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  100 
 
 		 2513 aa  5176    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  32.68 
 
 		 2864 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  32.71 
 
 		 3662 aa  288  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  31.38 
 
 		 3794 aa  279  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1524  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1619 aa  180  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.0000611783  normal  0.152369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.34 
 
 		 1753 aa  91.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4783  hypothetical protein  56 
 
 		 336 aa  90.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000597107  normal  0.813715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  27.59 
 
 		 1073 aa  77.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1172 aa  77  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1157 aa  72  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  27.51 
 
 		 1463 aa  70.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  36.19 
 
 		 809 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1743 aa  67  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  25.96 
 
 		 1461 aa  66.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0609  hypothetical protein  38.16 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313913  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  26.41 
 
 		 2843 aa  65.5  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1935 aa  65.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  37.63 
 
 		 913 aa  61.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  26.21 
 
 		 2510 aa  61.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  27.16 
 
 		 1480 aa  58.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  47.92 
 
 		 254 aa  53.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 956 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  22.76 
 
 		 2374 aa  52.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  31.78 
 
 		 2417 aa  51.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  32.43 
 
 		 1599 aa  51.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  24.92 
 
 		 944 aa  50.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  23.99 
 
 		 2443 aa  50.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  26.94 
 
 		 886 aa  50.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  30.53 
 
 		 920 aa  49.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  29.32 
 
 		 1740 aa  49.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1179 aa  49.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  31.25 
 
 		 2458 aa  49.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  25.42 
 
 		 628 aa  48.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  36.92 
 
 		 1352 aa  47.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1409 aa  47.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.3 
 
 		 1976 aa  47.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.49 
 
 		 2035 aa  46.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3706  hypothetical protein  35.29 
 
 		 270 aa  47  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534403  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1834 aa  47  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  29.71 
 
 		 928 aa  46.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  29.69 
 
 		 955 aa  46.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  36.78 
 
 		 2246 aa  46.2  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>