103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0201 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  46.58 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  43.42 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  48.68 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  33.68 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  44.52 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  37.99 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  47.18 
 
 		 1578 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  38.75 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  43.1 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  39.64 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  40.85 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  37.97 
 
 		 1698 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  75.38 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  50.91 
 
 		 1562 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  43.24 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  44.2 
 
 		 1632 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  39.6 
 
 		 1682 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  38.46 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  38.78 
 
 		 982 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  66.15 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  40.14 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  40.85 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  48.04 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  39.04 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  51.52 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  49 
 
 		 274 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  52.94 
 
 		 237 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  47.41 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  58.75 
 
 		 218 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  39.53 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  56.96 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  37.06 
 
 		 249 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  34.48 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  38.57 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  51.19 
 
 		 246 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  46.6 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  55.7 
 
 		 264 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  46.6 
 
 		 285 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  47.06 
 
 		 122 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  48.84 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  50.54 
 
 		 257 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  48.89 
 
 		 1669 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  41.07 
 
 		 275 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  50.62 
 
 		 240 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  57.14 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  55.13 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  50 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  38.57 
 
 		 1559 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  42.86 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  49.37 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  39.61 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  43.93 
 
 		 1723 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  46.84 
 
 		 1689 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  39.62 
 
 		 1658 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  48.44 
 
 		 1840 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  45.31 
 
 		 1959 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  34.33 
 
 		 1090 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  46.88 
 
 		 1942 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  45.31 
 
 		 1917 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  35.71 
 
 		 1976 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  36.94 
 
 		 2350 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  32.47 
 
 		 1623 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1600 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  34.62 
 
 		 1338 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  43.24 
 
 		 628 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  30.09 
 
 		 920 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  30.4 
 
 		 881 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  43.55 
 
 		 2277 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  42.86 
 
 		 1710 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  45.45 
 
 		 474 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  47.62 
 
 		 2615 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  32.65 
 
 		 869 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  43.33 
 
 		 2554 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  42.25 
 
 		 1405 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  45.45 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  34.62 
 
 		 2534 aa  46.6  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  45.45 
 
 		 554 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  37.74 
 
 		 2387 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  29.47 
 
 		 2428 aa  45.8  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  31.19 
 
 		 956 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  39.71 
 
 		 1517 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  36.11 
 
 		 1147 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1763 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1791 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 2942 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  43.33 
 
 		 2558 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  29.1 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  38.1 
 
 		 955 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  29.37 
 
 		 1046 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  31.82 
 
 		 3073 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  41.94 
 
 		 886 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  29.37 
 
 		 2510 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05471  hypothetical protein  35.37 
 
 		 91 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  31.86 
 
 		 913 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  41.11 
 
 		 2542 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30.7 
 
 		 2652 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  30.32 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>