142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2044 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  37.81 
 
 		 1632 aa  887    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1290 aa  849    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  63.33 
 
 		 1562 aa  1789    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  41.97 
 
 		 1682 aa  999    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1578 aa  3257    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  41.65 
 
 		 1283 aa  875    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  41.3 
 
 		 1281 aa  892    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  33.44 
 
 		 1723 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  36.6 
 
 		 1658 aa  742    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 		 1689 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  37.8 
 
 		 1312 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1698 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  34.16 
 
 		 982 aa  358  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1230 aa  295  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1559 aa  254  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  23.04 
 
 		 1267 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0986  hypothetical protein  23.61 
 
 		 725 aa  167  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  47.75 
 
 		 363 aa  151  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  31.47 
 
 		 1669 aa  148  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  48.84 
 
 		 380 aa  148  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  45.36 
 
 		 359 aa  140  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  46.63 
 
 		 338 aa  139  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  48.52 
 
 		 332 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  48.45 
 
 		 331 aa  136  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  47.95 
 
 		 371 aa  133  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  47.9 
 
 		 348 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  48 
 
 		 308 aa  123  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  47.18 
 
 		 317 aa  119  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  41.08 
 
 		 352 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  41.1 
 
 		 322 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  44.36 
 
 		 313 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  75.38 
 
 		 265 aa  108  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  39.16 
 
 		 314 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  45.52 
 
 		 328 aa  105  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  41.96 
 
 		 344 aa  105  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  40.13 
 
 		 300 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  59.04 
 
 		 262 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  60.26 
 
 		 401 aa  100  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  44.74 
 
 		 312 aa  99.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  40.71 
 
 		 303 aa  99.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  58.02 
 
 		 264 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  59.76 
 
 		 122 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  54.95 
 
 		 316 aa  96.3  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0987  hypothetical protein  26.42 
 
 		 506 aa  95.5  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  57.14 
 
 		 218 aa  95.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  47.41 
 
 		 237 aa  94  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  92  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  49.02 
 
 		 274 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  54.76 
 
 		 246 aa  90.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  59.38 
 
 		 295 aa  90.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  45.95 
 
 		 263 aa  89  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  33.53 
 
 		 378 aa  88.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  36 
 
 		 307 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  53.16 
 
 		 207 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  47.25 
 
 		 265 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  53.01 
 
 		 285 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  40.32 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  33.57 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  45.69 
 
 		 243 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  36.57 
 
 		 376 aa  83.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  48.24 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  23.02 
 
 		 1623 aa  79.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.25 
 
 		 3027 aa  79.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  33.5 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  47.62 
 
 		 263 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  50.63 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.94 
 
 		 738 aa  74.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.15 
 
 		 1917 aa  75.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1959 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  43.27 
 
 		 275 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.04 
 
 		 1942 aa  73.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1840 aa  71.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 3273 aa  68.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.38 
 
 		 2096 aa  65.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.82 
 
 		 2149 aa  63.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  24.75 
 
 		 931 aa  61.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 869 aa  60.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1669 aa  61.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1433 aa  59.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.18 
 
 		 1381 aa  59.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24 
 
 		 1599 aa  58.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.35 
 
 		 903 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  23.96 
 
 		 6272 aa  57.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.58 
 
 		 2035 aa  57  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  31.34 
 
 		 2194 aa  55.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1405 aa  55.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.02 
 
 		 2350 aa  55.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1400 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.92 
 
 		 1271 aa  54.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.03 
 
 		 2277 aa  54.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1611 aa  53.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 3689 aa  53.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  24.65 
 
 		 2762 aa  52.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  24.6 
 
 		 1423 aa  52.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  25.61 
 
 		 1457 aa  51.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  23.82 
 
 		 2224 aa  51.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  23.82 
 
 		 2224 aa  51.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  24.93 
 
 		 2416 aa  51.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  25.34 
 
 		 2961 aa  52  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1520 aa  50.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>