83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0342 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  57.87 
 
 		 265 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  56.89 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  58.72 
 
 		 380 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  57.31 
 
 		 363 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  58.08 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  43.66 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  59.3 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  49.56 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  50.3 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  47.62 
 
 		 1632 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  47.56 
 
 		 1682 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  46.99 
 
 		 1562 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  48.45 
 
 		 1578 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  46.39 
 
 		 982 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  47.55 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  46.48 
 
 		 1698 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  44.52 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  45.27 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  67.53 
 
 		 264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  55 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  50 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  59.78 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  42.07 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  45.07 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  39.88 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  39.11 
 
 		 1559 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  52.38 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  49.62 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  47.71 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  39.88 
 
 		 1658 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  32.86 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  42.75 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  63.75 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  48.18 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  60.26 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  55.42 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  62.5 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  44.96 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  38.42 
 
 		 1669 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  41.86 
 
 		 1723 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  58.23 
 
 		 218 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  38.38 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  50.55 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  60.76 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  42.18 
 
 		 285 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  35.89 
 
 		 240 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  51.58 
 
 		 122 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  51.3 
 
 		 207 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  56.96 
 
 		 263 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  47.19 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  41.55 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  55 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  60.87 
 
 		 257 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  53.16 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  34.31 
 
 		 1689 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  38.36 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  33.52 
 
 		 2961 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1917 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1763 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1942 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  30.16 
 
 		 690 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.42 
 
 		 1381 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  43.28 
 
 		 2277 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  29.82 
 
 		 3273 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  30.16 
 
 		 927 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  34.82 
 
 		 1623 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.61 
 
 		 738 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  31.48 
 
 		 2731 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1840 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  30.29 
 
 		 2831 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  39.56 
 
 		 2194 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  32.23 
 
 		 1147 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  30.95 
 
 		 1599 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  27.17 
 
 		 1732 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1834 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  26.25 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  32.34 
 
 		 474 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  38.55 
 
 		 2191 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  27.33 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1959 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1669 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1791 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>