178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2239 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  38.44 
 
 		 1632 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  43.06 
 
 		 1290 aa  872    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  100 
 
 		 1562 aa  3199    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  42.24 
 
 		 1682 aa  987    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  63.33 
 
 		 1578 aa  1787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  37.6 
 
 		 1312 aa  737    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  41.57 
 
 		 1283 aa  864    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  36.15 
 
 		 1658 aa  722    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  42.06 
 
 		 1281 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  33.58 
 
 		 1723 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  32.5 
 
 		 1689 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1698 aa  416  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  34.21 
 
 		 982 aa  351  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1230 aa  316  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1559 aa  300  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1267 aa  255  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  24.84 
 
 		 1669 aa  188  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0986  hypothetical protein  25.84 
 
 		 725 aa  174  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  46.51 
 
 		 363 aa  144  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  41.67 
 
 		 380 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  43.68 
 
 		 359 aa  140  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  47.93 
 
 		 332 aa  138  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  46.99 
 
 		 331 aa  135  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  46.71 
 
 		 371 aa  135  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  45.65 
 
 		 338 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  34.54 
 
 		 308 aa  122  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  44.02 
 
 		 348 aa  122  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  40.82 
 
 		 352 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  38.82 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  50.91 
 
 		 317 aa  109  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  72.46 
 
 		 265 aa  108  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  42.86 
 
 		 313 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  38.73 
 
 		 328 aa  101  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0987  hypothetical protein  26.4 
 
 		 506 aa  100  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  40.97 
 
 		 344 aa  99.8  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  40.94 
 
 		 218 aa  99.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  36.53 
 
 		 303 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  67.16 
 
 		 401 aa  95.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  52.53 
 
 		 122 aa  95.1  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  40.41 
 
 		 314 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  38.55 
 
 		 300 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  41.13 
 
 		 312 aa  94  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 3273 aa  93.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  45.45 
 
 		 316 aa  92  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  53.09 
 
 		 262 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  37.41 
 
 		 378 aa  89.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  51.85 
 
 		 274 aa  88.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  51.06 
 
 		 264 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  55 
 
 		 237 aa  85.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  61.54 
 
 		 295 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  28.25 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  53.75 
 
 		 246 aa  83.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  37.97 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  53.09 
 
 		 265 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  49.4 
 
 		 240 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  48.15 
 
 		 265 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  51.76 
 
 		 263 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1917 aa  76.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  51.25 
 
 		 263 aa  76.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1840 aa  75.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  46.32 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  47.78 
 
 		 290 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  42 
 
 		 275 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  28.37 
 
 		 249 aa  73.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.02 
 
 		 2096 aa  72.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.31 
 
 		 1528 aa  72.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  53.85 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.1 
 
 		 3027 aa  68.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1959 aa  68.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.63 
 
 		 1599 aa  67.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1623 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  23.88 
 
 		 2117 aa  66.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 913 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1942 aa  62.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 869 aa  62.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.14 
 
 		 2277 aa  61.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.87 
 
 		 1560 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1520 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.44 
 
 		 738 aa  61.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1551 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.62 
 
 		 1509 aa  59.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 3689 aa  59.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.23 
 
 		 1576 aa  59.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1550 aa  59.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 2486 aa  58.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.41 
 
 		 1271 aa  58.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.17 
 
 		 2350 aa  58.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  22.36 
 
 		 1259 aa  57.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  21.58 
 
 		 5236 aa  57  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1611 aa  57  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 628 aa  57  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  21.47 
 
 		 1669 aa  56.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  21.58 
 
 		 5189 aa  56.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4111  YD repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1687 aa  55.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1405 aa  55.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.15 
 
 		 1527 aa  55.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.73 
 
 		 2149 aa  55.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>