105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0987 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0987  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1041    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1267 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  26.4 
 
 		 1562 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1578 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1682 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1559 aa  89.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1281 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1632 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  23.24 
 
 		 1669 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1723 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1698 aa  71.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  25 
 
 		 982 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1283 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1290 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.61 
 
 		 2277 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25 
 
 		 3027 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  21.89 
 
 		 1689 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 2035 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1312 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  31.14 
 
 		 1400 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.54 
 
 		 1271 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.87 
 
 		 1489 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  23.41 
 
 		 1658 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1551 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1509 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.62 
 
 		 2149 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.55 
 
 		 2096 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  25.27 
 
 		 1160 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  23.54 
 
 		 1573 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1528 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1198 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1527 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1531 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  20.73 
 
 		 1381 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.83 
 
 		 1530 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.41 
 
 		 1593 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.27 
 
 		 1981 aa  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1942 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1525 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.78 
 
 		 738 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  21.26 
 
 		 1609 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.97 
 
 		 1626 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  24.52 
 
 		 1428 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  24.52 
 
 		 1579 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  24.71 
 
 		 2224 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  24.71 
 
 		 2224 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1552 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  23.47 
 
 		 678 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.44 
 
 		 1953 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  24.75 
 
 		 1543 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.03 
 
 		 1485 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1541 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 934 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1541 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1541 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1541 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1541 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  23.41 
 
 		 1046 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1547 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.41 
 
 		 2224 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  22.47 
 
 		 2221 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1917 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1541 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  25.57 
 
 		 1415 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  25.89 
 
 		 920 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  23.6 
 
 		 2225 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1959 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  22.98 
 
 		 1446 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  21.47 
 
 		 1539 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.64 
 
 		 889 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1583 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  24.02 
 
 		 613 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  25.81 
 
 		 1398 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.11 
 
 		 765 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  23.79 
 
 		 6272 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.33 
 
 		 903 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  21.7 
 
 		 1490 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.32 
 
 		 1381 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 1301 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  21.59 
 
 		 1149 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1620 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  23.3 
 
 		 2178 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25.47 
 
 		 1639 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  22.27 
 
 		 2246 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.19 
 
 		 1560 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1654 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  25.5 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  27.95 
 
 		 1338 aa  44.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  22.34 
 
 		 1390 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.51 
 
 		 917 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  23.4 
 
 		 1464 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  25.32 
 
 		 1399 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1319 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  26.13 
 
 		 1405 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1495 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.17 
 
 		 1576 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  24.6 
 
 		 891 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.66 
 
 		 1429 aa  43.9  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.42 
 
 		 1602 aa  43.9  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>