43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0986 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0986  hypothetical protein  100 
 
 		 725 aa  1486    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1230 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  25.84 
 
 		 1562 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1578 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1682 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25 
 
 		 1281 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1723 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1632 aa  137  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1290 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1658 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.93 
 
 		 1283 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1312 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  21.26 
 
 		 1267 aa  96.3  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1689 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1698 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1559 aa  57.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  24.61 
 
 		 1397 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  24.61 
 
 		 1411 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1377 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1411 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1397 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1411 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  24.61 
 
 		 1411 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  24.61 
 
 		 1377 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  24.61 
 
 		 1411 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4969  hypothetical protein  31.46 
 
 		 950 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  24.53 
 
 		 1365 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  24.53 
 
 		 1397 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  23.68 
 
 		 1308 aa  48.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  23.68 
 
 		 1399 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  23.68 
 
 		 1388 aa  47.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  23.68 
 
 		 1394 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  23.68 
 
 		 1409 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  23.61 
 
 		 1397 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  21.27 
 
 		 1379 aa  47.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  23.61 
 
 		 1411 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  25.84 
 
 		 2144 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  25.64 
 
 		 1400 aa  44.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  26.42 
 
 		 1398 aa  44.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  25 
 
 		 1426 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.56 
 
 		 1599 aa  44.3  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  25 
 
 		 1426 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.04 
 
 		 2277 aa  44.3  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>