220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01748 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  100 
 
 		 1230 aa  2552    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  26.97 
 
 		 1562 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1578 aa  296  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1632 aa  263  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1281 aa  261  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1312 aa  241  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1283 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1290 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  23.76 
 
 		 1682 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1723 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1267 aa  211  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1698 aa  198  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1689 aa  195  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0986  hypothetical protein  24.25 
 
 		 725 aa  175  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1658 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1559 aa  127  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  26.14 
 
 		 982 aa  109  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.54 
 
 		 3027 aa  102  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1352 aa  92.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  22.51 
 
 		 1271 aa  91.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.87 
 
 		 2149 aa  83.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  20.96 
 
 		 2035 aa  82.4  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.04 
 
 		 2096 aa  81.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4111  YD repeat-containing protein  21.59 
 
 		 1687 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4284  YD repeat-containing protein  21.59 
 
 		 1687 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.83 
 
 		 2277 aa  77  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1368 aa  76.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  21.98 
 
 		 1229 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.23 
 
 		 1599 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1611 aa  74.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.49 
 
 		 1485 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.42 
 
 		 1560 aa  72  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1319 aa  72  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  22.87 
 
 		 1565 aa  71.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  22.87 
 
 		 1565 aa  71.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1520 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  22.24 
 
 		 2402 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1600 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  22.17 
 
 		 1508 aa  69.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1390 aa  68.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  24.83 
 
 		 1398 aa  68.2  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1527 aa  67.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.84 
 
 		 1586 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.26 
 
 		 1595 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  22.59 
 
 		 2401 aa  67.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  22.45 
 
 		 2437 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  22.25 
 
 		 1489 aa  66.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1840 aa  66.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  23.56 
 
 		 1429 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  20.46 
 
 		 1421 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  23.04 
 
 		 1189 aa  65.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.3 
 
 		 1576 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  21.9 
 
 		 1579 aa  65.1  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  21.9 
 
 		 1428 aa  65.1  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  22.34 
 
 		 2283 aa  64.7  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  23.86 
 
 		 1426 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  21.43 
 
 		 867 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  21.76 
 
 		 1547 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  22.73 
 
 		 1518 aa  63.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1410 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  21.47 
 
 		 1953 aa  62.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  22.79 
 
 		 1400 aa  62.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  21.27 
 
 		 1527 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  23.22 
 
 		 1543 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  24.83 
 
 		 1200 aa  62  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1216 aa  62  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  23.43 
 
 		 1405 aa  62  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  23.51 
 
 		 1426 aa  61.6  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1426 aa  61.6  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.61 
 
 		 1551 aa  62  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1602 aa  61.6  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.47 
 
 		 1550 aa  61.6  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1268 aa  61.6  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  22.53 
 
 		 1381 aa  61.6  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  21.73 
 
 		 1623 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1419 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1552 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  24.28 
 
 		 1411 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  23.16 
 
 		 765 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  21.82 
 
 		 1541 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  22.08 
 
 		 1429 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1495 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1411 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1397 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.42 
 
 		 3193 aa  60.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  21.82 
 
 		 1541 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  21.53 
 
 		 1541 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  23.29 
 
 		 2448 aa  60.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  23.82 
 
 		 1669 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  21.41 
 
 		 1541 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  21.41 
 
 		 1541 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  21.41 
 
 		 1541 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  21.35 
 
 		 1381 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  23.05 
 
 		 1609 aa  59.3  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1377 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  24.28 
 
 		 1377 aa  59.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  20.38 
 
 		 1401 aa  58.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  21.74 
 
 		 1981 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.06 
 
 		 1942 aa  58.9  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  23.86 
 
 		 1397 aa  58.5  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>