87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1811 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  46.53 
 
 		 363 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  39.23 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  42.76 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  41.26 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  44.44 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  42.17 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  41.67 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  42 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  45.77 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  42.75 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  38.03 
 
 		 1682 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  39.02 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  37.16 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  40.71 
 
 		 1578 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  36.25 
 
 		 352 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  29.29 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  38.95 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  36.53 
 
 		 1562 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  35.92 
 
 		 982 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  53.49 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  38.67 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  66.67 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  32.03 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  38.57 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  36.81 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  49.52 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  34.44 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  51.76 
 
 		 218 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  42.34 
 
 		 249 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  38.46 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  45.63 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  33.52 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  32.96 
 
 		 1698 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  53.16 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  48 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  36.73 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  56.79 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  45.22 
 
 		 378 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  50.63 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  35.86 
 
 		 1559 aa  85.9  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  46.53 
 
 		 262 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  47.92 
 
 		 122 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  49.38 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  41.35 
 
 		 1632 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  50.6 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  37.32 
 
 		 1658 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  42.74 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  33.53 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  51.9 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  45.1 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  40.37 
 
 		 1669 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1723 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  46.15 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1689 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  43.28 
 
 		 628 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1834 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  40.32 
 
 		 2416 aa  49.3  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 1959 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  29.91 
 
 		 722 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  29.06 
 
 		 2413 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  30.4 
 
 		 474 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1854 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  29.37 
 
 		 2961 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  39.44 
 
 		 2349 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  36.36 
 
 		 482 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  32.99 
 
 		 2035 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  27.56 
 
 		 2075 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  39.19 
 
 		 554 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  32.53 
 
 		 2428 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  31.73 
 
 		 2277 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 		 2942 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  34.88 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  33.75 
 
 		 2497 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  36.27 
 
 		 869 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  34.91 
 
 		 2542 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1147 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40 
 
 		 1825 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40 
 
 		 2032 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40 
 
 		 1806 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40 
 
 		 1825 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  40 
 
 		 2031 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40 
 
 		 2031 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40 
 
 		 2031 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  31.75 
 
 		 1732 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>