106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4723 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  719    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  51.23 
 
 		 363 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  54.8 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  50.81 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  54.55 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  54.24 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  52.33 
 
 		 348 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  46.96 
 
 		 371 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  50.3 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  41.42 
 
 		 1682 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  43.06 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  40.83 
 
 		 982 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  40.82 
 
 		 1562 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  41.38 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  44.06 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  50.89 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  40.78 
 
 		 1578 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  74.24 
 
 		 265 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  39.64 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  39.86 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  49.51 
 
 		 1632 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  50 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  53.12 
 
 		 264 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  55.77 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  46.1 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  40.15 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  52.25 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  33.86 
 
 		 1698 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  57.83 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  63.64 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  50.5 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  53.49 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  51.81 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  36.25 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  37.93 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  41.26 
 
 		 316 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  32.8 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  35.81 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  38.46 
 
 		 263 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  61.54 
 
 		 257 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  37.43 
 
 		 1723 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  52.87 
 
 		 122 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  37.76 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  52.44 
 
 		 218 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  55.7 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  33.15 
 
 		 1669 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  34.76 
 
 		 1658 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  47.73 
 
 		 263 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  56.25 
 
 		 240 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  44.07 
 
 		 207 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1559 aa  86.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  47.83 
 
 		 237 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  53.16 
 
 		 246 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  53.09 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  34.34 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  51.56 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  31.46 
 
 		 1689 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1942 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  38.46 
 
 		 2277 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  25.69 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  40.32 
 
 		 1917 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  29.32 
 
 		 1732 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.27 
 
 		 1599 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1840 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  45.21 
 
 		 2387 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1763 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  37.23 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.35 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.53 
 
 		 2094 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 3273 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  37.8 
 
 		 690 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  30.56 
 
 		 2113 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  33.65 
 
 		 628 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  28.67 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  34.71 
 
 		 1147 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1433 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.49 
 
 		 1381 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  34.58 
 
 		 1600 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  46.15 
 
 		 2350 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  42.86 
 
 		 1710 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1517 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  32.56 
 
 		 554 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  42.67 
 
 		 2542 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  32.97 
 
 		 2349 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  26.62 
 
 		 765 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1628 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1791 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1669 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  34.88 
 
 		 2658 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  38.33 
 
 		 1806 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  38.33 
 
 		 1825 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  38.33 
 
 		 1825 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  38.33 
 
 		 2031 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  38.33 
 
 		 2031 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  28.82 
 
 		 2961 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  38.33 
 
 		 2031 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  38.33 
 
 		 2032 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  28.57 
 
 		 1976 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  32.17 
 
 		 311 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 		 869 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>