144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6648 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  100 
 
 		 2113 aa  4288    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  38.03 
 
 		 2046 aa  1028    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  32.68 
 
 		 2038 aa  740    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  33.99 
 
 		 2585 aa  405  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  42.56 
 
 		 1931 aa  335  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  30.15 
 
 		 1531 aa  313  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1101 aa  179  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  42.63 
 
 		 451 aa  162  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  40.89 
 
 		 577 aa  150  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1164 aa  135  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.07 
 
 		 1147 aa  127  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  26.24 
 
 		 948 aa  126  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.62 
 
 		 2447 aa  123  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  25.47 
 
 		 958 aa  123  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  26.44 
 
 		 2215 aa  96.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25.05 
 
 		 2178 aa  96.3  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.23 
 
 		 2225 aa  95.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  25.96 
 
 		 1037 aa  94.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.63 
 
 		 2246 aa  85.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  28.95 
 
 		 3273 aa  84.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  22.68 
 
 		 2224 aa  82  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.19 
 
 		 2096 aa  81.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  23.09 
 
 		 2224 aa  80.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  23.09 
 
 		 2224 aa  80.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.51 
 
 		 3073 aa  79.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  26.01 
 
 		 2031 aa  78.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1352 aa  73.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1375 aa  72.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.67 
 
 		 2149 aa  71.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25.95 
 
 		 2221 aa  70.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.85 
 
 		 1271 aa  70.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1209 aa  68.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.27 
 
 		 1917 aa  66.6  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.69 
 
 		 1595 aa  65.9  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.69 
 
 		 1586 aa  65.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1840 aa  62  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.56 
 
 		 2942 aa  61.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.44 
 
 		 3027 aa  61.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  22 
 
 		 869 aa  61.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  27.72 
 
 		 2318 aa  60.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  27.13 
 
 		 2191 aa  59.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1942 aa  58.9  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.38 
 
 		 1959 aa  58.9  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1623 aa  58.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1669 aa  58.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  24.07 
 
 		 2658 aa  57  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 2035 aa  57  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1550 aa  57  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  27.24 
 
 		 1539 aa  56.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1520 aa  55.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  26.9 
 
 		 1539 aa  55.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  21.66 
 
 		 1547 aa  55.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.18 
 
 		 1530 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.18 
 
 		 1609 aa  54.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.43 
 
 		 1614 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1698 aa  54.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1551 aa  53.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  24.75 
 
 		 765 aa  53.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.73 
 
 		 2277 aa  53.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  22.62 
 
 		 1679 aa  53.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  22.77 
 
 		 1579 aa  52.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.59 
 
 		 678 aa  52.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  22.77 
 
 		 1428 aa  52.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.86 
 
 		 1568 aa  52.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  24.16 
 
 		 504 aa  52.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.08 
 
 		 1599 aa  52  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.72 
 
 		 1953 aa  52  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.59 
 
 		 2731 aa  52  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.95 
 
 		 1381 aa  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 628 aa  52.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.99 
 
 		 2094 aa  52  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1527 aa  52.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.74 
 
 		 1626 aa  51.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.42 
 
 		 1600 aa  51.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1558 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  22.7 
 
 		 1673 aa  50.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 3689 aa  50.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  23.63 
 
 		 2076 aa  50.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.53 
 
 		 927 aa  50.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.46 
 
 		 1485 aa  50.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  22.77 
 
 		 613 aa  50.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  28 
 
 		 1467 aa  50.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.69 
 
 		 2349 aa  50.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  22.91 
 
 		 3193 aa  49.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1390 aa  50.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  26.86 
 
 		 924 aa  50.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  24.3 
 
 		 1998 aa  49.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  25.71 
 
 		 6272 aa  49.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  22.32 
 
 		 1576 aa  49.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1602 aa  49.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  21.78 
 
 		 1732 aa  49.3  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  22.41 
 
 		 2290 aa  48.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.08 
 
 		 1362 aa  48.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 		 2286 aa  48.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  40.79 
 
 		 2387 aa  48.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  28.69 
 
 		 1140 aa  48.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1197 aa  48.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  23.17 
 
 		 1160 aa  48.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.9 
 
 		 2350 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.73 
 
 		 1485 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>