164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1350 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  38.15 
 
 		 2113 aa  1021    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2046 aa  4095    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  34.86 
 
 		 2038 aa  820    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  33.89 
 
 		 1531 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  33.66 
 
 		 2585 aa  369  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1101 aa  237  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.64 
 
 		 1147 aa  186  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  27.7 
 
 		 948 aa  161  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1164 aa  157  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  39.57 
 
 		 451 aa  154  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  27.79 
 
 		 958 aa  153  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1931 aa  145  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  36.07 
 
 		 577 aa  122  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1375 aa  113  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  28.89 
 
 		 1037 aa  109  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.88 
 
 		 2447 aa  105  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  27.3 
 
 		 2031 aa  94  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  28.24 
 
 		 2215 aa  90.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 3273 aa  86.7  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1081 aa  77.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1209 aa  75.9  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.41 
 
 		 2096 aa  69.3  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  21.87 
 
 		 2225 aa  69.3  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1352 aa  69.3  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26.5 
 
 		 1539 aa  67  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  23.71 
 
 		 2076 aa  67  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  21.96 
 
 		 2178 aa  66.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  32 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  26.23 
 
 		 1539 aa  65.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1840 aa  65.9  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.95 
 
 		 1271 aa  65.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0438  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  64.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1942 aa  63.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 3333 aa  63.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1959 aa  63.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1917 aa  63.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.77 
 
 		 1669 aa  62.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  28.68 
 
 		 2035 aa  61.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 3689 aa  60.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  22.94 
 
 		 2003 aa  60.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.16 
 
 		 1572 aa  60.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  20.76 
 
 		 2246 aa  59.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.59 
 
 		 3073 aa  59.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.3 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.3 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  25 
 
 		 2387 aa  59.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  23.71 
 
 		 840 aa  59.3  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.22 
 
 		 1576 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  21.74 
 
 		 2224 aa  58.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  24.79 
 
 		 2658 aa  58.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.36 
 
 		 3027 aa  58.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  20.84 
 
 		 2221 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  22.2 
 
 		 2224 aa  57.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.46 
 
 		 1560 aa  57.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  22.2 
 
 		 2224 aa  57.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.05 
 
 		 1732 aa  57.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  23.36 
 
 		 1140 aa  57.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1558 aa  57  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.46 
 
 		 1381 aa  56.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  26.52 
 
 		 1710 aa  56.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.76 
 
 		 1614 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  28.28 
 
 		 1400 aa  56.2  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  27.46 
 
 		 1426 aa  56.2  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 628 aa  55.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  27.46 
 
 		 1429 aa  55.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  27.03 
 
 		 1426 aa  55.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  25.54 
 
 		 2510 aa  55.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25 
 
 		 1586 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25 
 
 		 1595 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  28.28 
 
 		 1398 aa  55.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1426 aa  55.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  23.26 
 
 		 1593 aa  54.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.68 
 
 		 678 aa  54.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  25.1 
 
 		 396 aa  54.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  29.28 
 
 		 1200 aa  53.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  24.7 
 
 		 1543 aa  53.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.12 
 
 		 1485 aa  54.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1552 aa  54.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1268 aa  54.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1216 aa  54.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1583 aa  53.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  23.96 
 
 		 2413 aa  53.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.34 
 
 		 2350 aa  53.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  23.75 
 
 		 1427 aa  52.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.5 
 
 		 1467 aa  52.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.31 
 
 		 2149 aa  52.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  25.88 
 
 		 1410 aa  52.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.37 
 
 		 1464 aa  52.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  27.36 
 
 		 2191 aa  52.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  34.56 
 
 		 456 aa  52.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.16 
 
 		 927 aa  52  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 3193 aa  52  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.9 
 
 		 2277 aa  51.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.04 
 
 		 741 aa  51.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  24.08 
 
 		 2290 aa  51.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1611 aa  51.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  23.99 
 
 		 1411 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  27.75 
 
 		 800 aa  51.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  23.81 
 
 		 1377 aa  50.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 2494 aa  50.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>