29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1645 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  90.51 
 
 
948 aa  1701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  100 
 
 
958 aa  1944    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  32.2 
 
 
1101 aa  341  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.57 
 
 
1147 aa  278  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  29.23 
 
 
1164 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 
2038 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  27.68 
 
 
1375 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  28.81 
 
 
1037 aa  153  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  33.51 
 
 
2031 aa  151  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  27.34 
 
 
2046 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  26.39 
 
 
1209 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  31.03 
 
 
508 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  27.65 
 
 
2113 aa  90.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.18 
 
 
864 aa  83.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  27.01 
 
 
1931 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  32.18 
 
 
2585 aa  77.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  25.74 
 
 
714 aa  76.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.04 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  33.52 
 
 
2447 aa  63.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.45 
 
 
523 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.61 
 
 
1064 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  26.98 
 
 
570 aa  58.9  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.65 
 
 
2225 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.32 
 
 
2246 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  22.79 
 
 
2178 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  22.35 
 
 
2224 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  22.35 
 
 
2224 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  22.35 
 
 
2224 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  23.76 
 
 
4761 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>