19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0554 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  100 
 
 		 570 aa  1144    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2370  hypothetical protein  48.08 
 
 		 216 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0389898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1101 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  25 
 
 		 714 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1164 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.63 
 
 		 1147 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1931 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.79 
 
 		 864 aa  70.5  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.15 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  26.98 
 
 		 958 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  24.93 
 
 		 948 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1576 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  29.92 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  23.41 
 
 		 643 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.43 
 
 		 11716 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.76 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.56 
 
 		 1064 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  25.2 
 
 		 4357 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  24.88 
 
 		 4761 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>