16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1231 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  100 
 
 		 1209 aa  2367    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  29.34 
 
 		 2031 aa  224  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1375 aa  205  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  30.24 
 
 		 1037 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1101 aa  161  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  26.85 
 
 		 948 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  26.76 
 
 		 958 aa  154  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1164 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.9 
 
 		 1147 aa  129  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  27.71 
 
 		 2046 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 2038 aa  91.3  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1931 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  32.91 
 
 		 2113 aa  81.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  28.57 
 
 		 2585 aa  65.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.09 
 
 		 600 aa  52.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  29.26 
 
 		 508 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>