69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7437 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  100 
 
 
1101 aa  2191    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  35.81 
 
 
1164 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.7 
 
 
1147 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 
2038 aa  335  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  32.13 
 
 
948 aa  335  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  32.2 
 
 
958 aa  332  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  33.38 
 
 
1037 aa  263  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  33.14 
 
 
1375 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  32.98 
 
 
714 aa  247  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  32.07 
 
 
2046 aa  225  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  25.79 
 
 
2113 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  35.48 
 
 
2031 aa  173  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  29.45 
 
 
2585 aa  156  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  39.11 
 
 
1931 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  28.78 
 
 
570 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  35.68 
 
 
508 aa  145  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  27.74 
 
 
1209 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.75 
 
 
1064 aa  131  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  43.07 
 
 
864 aa  128  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.07 
 
 
456 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  37.56 
 
 
523 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  25.29 
 
 
1367 aa  92  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  26.65 
 
 
2447 aa  82.4  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.71 
 
 
6678 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0562  hypothetical protein  34.09 
 
 
391 aa  77.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  20.94 
 
 
1374 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  24.88 
 
 
4357 aa  71.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  21.63 
 
 
2225 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  22.37 
 
 
2246 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  20.69 
 
 
2178 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  32.38 
 
 
739 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  31.6 
 
 
739 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  30.81 
 
 
846 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  22.58 
 
 
1306 aa  59.7  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  26.63 
 
 
1735 aa  58.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  20.87 
 
 
2224 aa  58.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  20.87 
 
 
2224 aa  58.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  20.87 
 
 
2224 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2370  hypothetical protein  29.19 
 
 
216 aa  58.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0389898 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.07 
 
 
11716 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  25.94 
 
 
643 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  28.09 
 
 
2318 aa  57.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4167  hypothetical protein  31.91 
 
 
382 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000267335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  25.23 
 
 
1013 aa  55.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  29.17 
 
 
767 aa  54.3  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 
3273 aa  54.3  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  21.71 
 
 
2221 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
757 aa  52.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  26.13 
 
 
1699 aa  52.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  24.02 
 
 
3907 aa  52.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  26.64 
 
 
2066 aa  52.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  25.21 
 
 
1504 aa  52.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  24.46 
 
 
2215 aa  52  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.68 
 
 
4433 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  35.51 
 
 
786 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  23.47 
 
 
252 aa  48.9  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  26.67 
 
 
313 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  28.29 
 
 
1265 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.82 
 
 
1298 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  24.19 
 
 
251 aa  47.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  26.94 
 
 
430 aa  48.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  28.64 
 
 
420 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1239  hypothetical protein  26.34 
 
 
808 aa  46.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  29.89 
 
 
1072 aa  46.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  27.23 
 
 
2503 aa  46.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.65 
 
 
306 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  25.42 
 
 
1413 aa  45.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  25.42 
 
 
471 aa  45.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  27.01 
 
 
4761 aa  45.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>